针对您提出的“涉嫌违法企业开具的发票如何处理”的问题，这确实是一个涉及税务管理和法律责任的重要议题。以下是我根据相关法律法规和政策，为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，如果企业涉嫌违法，特别是涉及发票的违法行为，如虚开发票、非法代开发票等，这些行为将受到税务机关的严厉处罚。根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，对于虚开发票的行为，税务机关将没收违法所得，并根据虚开金额的大小，处以不同额度的罚款。如果虚开金额超过一定数额，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。

对于涉嫌违法企业开具的发票，具体处理方式如下：

1. 发票的效力问题：

   • 如果发票是涉嫌违法企业虚开的，那么这些发票在法律上将被视为无效发票，不能作为财务报销凭证，也不能用于抵扣税款。
   • 如果发票是合法开具但企业后续涉嫌违法，且发票本身与违法活动无直接关联，那么发票的效力可能不受影响，但仍需根据具体情况由税务机关进行判定。

2. 税务机关的处理措施：

   • 税务机关在发现企业涉嫌违法开具发票后，会立即展开调查，并根据调查结果采取相应的处罚措施。
   • 对于已经开具的涉嫌违法发票，税务机关可能会要求企业进行作废或红冲处理，并重新开具合法发票。
   • 如果发票已经用于抵扣税款或作为财务报销凭证，税务机关可能会要求企业补缴税款，并处以罚款。

3. 对出口退（免）税业务的影响：

   • 如果企业涉嫌接受虚开增值税专用发票并被税务机关立案检查，其出口退（免）税业务将受到直接影响。
   • 在立案检查期间，所涉及的出口业务将暂不办理出口退（免）税。如果已经办理，税务机关将按照所涉及的退税额暂扣企业其他已审核通过的应退税款。
   • 待税务机关核实排除疑点后，方可继续按照规定办理出口退（免）税或解除暂扣应退税款。

4. 企业的应对措施：

   • 企业应严格遵守发票管理法规，确保发票的合法性和真实性。
   • 如果发现自身或合作伙伴存在涉嫌违法开具发票的行为，应立即向税务机关报告，并积极配合调查。
   • 企业应加强内部管理，建立健全发票管理制度，防止类似问题的再次发生。

综上所述，涉嫌违法企业开具的发票将受到税务机关的严厉处罚，并可能影响企业的出口退（免）税业务。因此，企业应严格遵守相关法律法规，确保发票的合法性和真实性，以维护自身的合法权益和声誉。如果您或您的企业遇到类似问题，建议及时咨询专业税务律师或税务机关，以获取更具体的指导和帮助。