对于两个未成年人互殴，在公安机关进行处罚后，法院的判决会根据具体情况有所不同，主要取决于互殴行为的性质、后果以及双方的年龄等因素。以下分情况详细说明：
若互殴行为未构成犯罪
- 民事赔偿部分：法院会依据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的相关规定，判决侵权方（即打人的一方或双方中过错较大的一方）承担相应的民事赔偿责任。这包括赔偿医疗费、护理费、交通费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入（如果未成年人有工作的话，但这种情况较为少见）。对于未成年人造成的损害，通常由其监护人承担赔偿责任。
- 调解与和解：在诉讼过程中，法院也会积极促使双方进行调解或和解，以达成一个双方都能接受的赔偿方案，从而避免进一步的法律纠纷。
若互殴行为构成犯罪（如故意伤害罪等）
- 刑事责任部分：根据《中华人民共和国刑法》的规定，已满十六周岁的人犯罪，应当负刑事责任。已满十四周岁不满十六周岁的人，犯故意伤害致人重伤或者死亡等特定罪行的，也应当负刑事责任。对于不满十八周岁的人犯罪，法院会从轻或者减轻处罚。
- 量刑考虑因素：在量刑时，法院会综合考虑犯罪的性质、情节、后果以及被告人的年龄、认罪态度、悔罪表现等因素。对于未成年人犯罪，法院通常会更加注重教育、感化和挽救，尽量给予改过自新的机会。
- 民事赔偿部分：与未构成犯罪的情况类似，法院会判决侵权方承担相应的民事赔偿责任。同时，如果被告人有个人财产，法院也可以判决用其个人财产支付赔偿费用；不足部分，由其监护人赔偿。
特殊情况处理
- 如果双方都是未成年人，且互殴行为情节轻微：法院可能会依据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，对双方进行批评教育或者处以较轻的处罚，而不涉及刑事责任。
- 如果互殴行为导致一方或双方严重受伤：除了上述的民事赔偿和可能的刑事责任外，法院还可能考虑对受伤方进行司法救助或者引导其通过其他途径寻求帮助。
建议：对于未成年人互殴的案件，建议家长或监护人及时介入，引导孩子认识错误、积极赔偿并寻求和解。如果案件已经进入司法程序，建议积极配合法院的工作，尊重法院的判决结果。如果对判决结果有异议，可以在法定期限内提出上诉或者申诉。
最后，每个案件的具体情况都有所不同，法院的判决也会因案件事实、证据以及法律适用等因素而有所差异。因此，在处理未成年人互殴的案件时，建议咨询专业律师以获取更具体、更准确的法律意见。如果你有相关法律问题，可以直接向我咨询。