公司的规章制度是否合法，需从多个角度进行综合判断，以下是一些关键考量因素：
制定程序的合法性：
- 规章制度应当经过民主程序制定，即应当与公司工会或者职工代表协商确定，确保员工的参与权和知情权。如果公司未遵循这一程序，规章制度的合法性可能会受到质疑。
- 规章制度制定后，应当向员工进行公示或告知，确保员工了解并遵守。未公示或告知的规章制度，对员工不具有约束力。
内容的合法性：
- 规章制度的内容不得违反国家法律法规的强制性规定，如劳动法、劳动合同法等。例如，规章制度中不得规定低于法定最低工资标准的薪酬，不得剥夺员工法定的休息休假权利等。
- 规章制度的内容应当合理，不得显失公平或侵犯员工的合法权益。例如，规章制度中不得设置不合理的罚款条款，不得对员工进行歧视性对待等。
与劳动合同的协调性：
- 规章制度应当与劳动合同的内容相协调，不得与劳动合同相冲突。如果规章制度与劳动合同存在冲突，应当以劳动合同为准，因为劳动合同是双方自愿达成的协议，具有更高的法律效力。
实际执行中的合法性：
- 公司在执行规章制度时，应当遵循公平、公正、公开的原则，不得滥用规章制度对员工进行不公正的处罚或解雇。
- 公司在执行规章制度时，应当保留相关证据，如员工违规的证据、处罚决定的依据等，以备在劳动争议中作为证据使用。
若公司规章制度存在不合法之处，可能面临的法律后果包括：
- 规章制度无效：如果规章制度违反法律法规的强制性规定或显失公平，可能会被认定为无效，从而对公司和员工均不产生约束力。
- 劳动争议：员工可能会因公司规章制度的不合法而提起劳动争议，要求公司承担相应的法律责任，如支付经济补偿、赔偿损失等。
- 行政处罚：如果公司规章制度违反法律法规的强制性规定，可能会受到相关行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。
建议：
- 公司应当定期审查规章制度的合法性和合理性，确保规章制度符合国家法律法规的要求，并适应公司发展的需要。
- 在制定或修改规章制度时，公司应当充分征求员工的意见和建议，确保规章制度的民主性和科学性。
- 在执行规章制度时，公司应当遵循公平、公正、公开的原则，确保规章制度的严肃性和权威性。
如有任何关于公司规章制度合法性的疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。