若您认为部队机关制造了冤案，您可以通过以下途径来维护自身合法权益：
内部申诉与复议：
- 首先，您可以尝试通过部队内部的申诉机制来解决问题。部队通常设有相应的纪律检查或申诉部门，负责处理内部人员的投诉和申诉。
- 提交详细的申诉材料，包括事件经过、证据材料以及您认为冤枉的具体理由。确保您的申诉内容条理清晰，证据充分。
- 等待部队内部的复议结果。如果复议结果仍不能令您满意，您可以考虑进一步采取法律行动。
寻求法律援助与提起诉讼：
- 如果您认为部队机关的行为严重侵犯了您的合法权益，且内部申诉无果，您可以寻求专业的法律援助。
- 咨询有处理军事或行政诉讼经验的律师，了解您的案件是否具备提起诉讼的条件，以及诉讼的可能结果和风险。
- 在律师的指导下，准备相关证据材料，向有管辖权的人民法院提起诉讼，要求撤销或改正部队机关的错误决定，并寻求相应的赔偿。
向相关部门反映情况：
- 您还可以向部队的上级机关、军事检察院或军事法院等相关部门反映情况，寻求他们的帮助和监督。
- 这些部门通常具有更高的权威性和独立性，能够对部队机关的行为进行更全面的审查和监督。
- 在反映情况时，同样需要提供详细的证据材料和情况说明，以便相关部门能够准确了解事实真相并作出相应处理。
在处理此类案件时，您需要注意以下几点：
- 保持冷静与理性：面对冤案，情绪激动是可以理解的，但保持冷静与理性对于解决问题至关重要。避免采取过激行为或发表不当言论，以免给自己带来不必要的麻烦。
- 及时收集与保存证据：证据是证明您冤枉的关键。因此，您需要尽可能及时地收集与保存与案件相关的所有证据材料，包括书面文件、录音录像、证人证言等。
- 遵循法律程序：在维护自身权益的过程中，您需要严格遵守法律程序和相关规定。不要试图通过非法手段来解决问题，否则可能会给自己带来更大的法律风险。
最后，我建议您在处理此类案件时保持耐心与信心。法律程序可能需要一定的时间来推进，但只要您坚持下去并积极配合律师和相关部门的调查工作，相信最终能够还您一个公道。如果您在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。