让机构违规颁发资质证书，这一行为是否会判刑，取决于具体的行为性质、情节严重程度以及造成的后果等因素，可能涉及多个罪名，以下分情况讨论：

1. 若行为构成提供虚假证明文件罪：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国刑法》第二百二十九条的规定，承担资产评估、验资、验证、会计、审计、法律服务、保荐、安全评价、环境影响评价、环境监测等职责的中介组织的人员故意提供虚假证明文件，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；有下列情形之一的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金：（一）提供与证券发行相关的虚假的资产评估、会计、审计、法律服务、保荐等证明文件，情节特别严重的；（二）提供与重大资产交易相关的虚假的资产评估、会计、审计等证明文件，情节特别严重的；（三）在涉及公共安全的重大工程、项目中提供虚假的安全评价、环境影响评价等证明文件，致使公共财产、国家和人民利益遭受特别重大损失的。虽然该条款直接针对的是中介组织人员，但若机构或其工作人员在颁发资质证书过程中，故意提供虚假证明文件，且情节严重，亦可参照此条款追究刑事责任，尤其是当机构被视为或实际承担了类似中介组织的职责时。
   • 可能后果：若构成此罪，将面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；情节特别严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

2. 若行为构成滥用职权罪或玩忽职守罪：

   • 法律背景：如果机构或其工作人员是国家机关工作人员，在颁发资质证书过程中滥用职权或者玩忽职守，致使公共财产、国家和人民利益遭受重大损失的，根据《中华人民共和国刑法》第三百九十七条的规定，将构成滥用职权罪或玩忽职守罪，处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
   • 可能后果：若构成此罪，国家机关工作人员将面临三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。

3. 若行为构成其他相关犯罪：

   • 法律背景：除了上述罪名外，如果机构或其工作人员在颁发资质证书过程中还涉及其他违法行为，如受贿、行贿等，还可能构成其他相关犯罪，如受贿罪、行贿罪等，将根据具体罪名和情节进行处罚。
   • 可能后果：根据具体罪名和情节，可能面临不同的刑罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。

法律建议：

• 对于机构而言，应严格遵守相关法律法规和规章制度，确保颁发资质证书的合法性和合规性。
• 对于个人而言，如果涉及此类行为，应立即停止违法行为，并主动向相关部门说明情况，争取从轻或减轻处罚。
• 如果已经面临法律纠纷或刑事指控，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自身合法权益。

总结：让机构违规颁发资质证书是否会判刑，取决于具体行为性质、情节严重程度以及造成的后果等因素。如果构成犯罪，将面临相应的刑事处罚。因此，建议机构和个人严格遵守相关法律法规，避免涉及此类违法行为。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。