双方签字按手印的协议，在一般情况下是有效的，但具体有效性还需结合多个因素进行综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 行为人具有相应的民事行为能力

   • 双方当事人必须具备能够独立实施民事法律行为的资格。对于自然人而言，完全民事行为能力人（如年满18周岁且精神健康的成年人）可以独立签订协议。若一方为限制民事行为能力人或无民事行为能力人，则可能影响协议的效力。对于法人和非法人组织，应在其核准登记的经营范围内或法律规定的权限范围内签订协议。

2. 意思表示真实

   • 协议必须是双方自愿、平等协商的结果，且表示与内心真实意愿一致。若存在欺诈、胁迫等不正当手段导致一方在非自愿情况下签订协议，受损害方有权请求法院或仲裁机构撤销该协议。例如，如果一方在签订协议时受到威胁或欺骗，那么该协议可能被视为无效。

3. 协议内容合法合规

   • 协议内容不得违反国家法律法规的强制性规定，也不能损害社会公共利益或他人合法权益。否则，该协议将被视为无效。比如，买卖毒品的协议因违反刑法而无效。同时，协议也不能违背社会公共秩序和善良风俗（公序良俗），如签订限制他人婚姻自由的协议即属此例，同样会被视为无效。

4. 签字与按手印的真实性

   • 签字和按手印是对协议内容的确认和认可。只要双方当事人都具有完全民事行为能力，并且签字按手印是其真实意思表示，这样的行为通常足以证明协议的有效性。按手印作为一种传统的身份确认方式，在现代合同法中依然有效，它与签字、盖章在法律上具有同等的效力。

5. 满足特定形式要求

   • 根据某些特定法律或行业规定，协议可能还需满足其他形式要求，如公证、见证、批准、登记等。这些要求因地区、行业或具体情况而有所不同，必须严格遵守以确保协议的有效性。例如，某些房地产交易协议可能需要经过公证才能生效。

举例说明：

• 假设甲乙双方签订了一份买卖合同，双方均具备完全民事行为能力，合同内容合法合规，且双方自愿签字并按手印确认。在这种情况下，该合同是有效的，双方应按照合同约定履行各自的义务。
• 反之，如果甲乙双方中的一方在签订合同时受到欺诈或胁迫，或者合同内容违反了法律法规的强制性规定，那么该合同可能被视为无效。

建议：

• 在签订协议前，务必仔细审查协议内容，确保自己完全同意合同条款后再进行确认。
• 选择适合自己情况的确认方式，可以是签字、盖章或按手印，或者结合多种方式以增强协议的法律效力。
• 如果在协议签订过程中有任何疑问或不确定之处，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。

综上所述，双方签字按手印的协议在一般情况下是有效的，但具体有效性还需结合行为人能力、双方意愿、协议内容、签字与按手印的真实性以及可能存在的形式要求等因素进行综合判断。