结论：三方协议不交给学校可能会对毕业生的毕业手续、户口档案迁移、就业权益保障以及学校的就业统计和管理工作产生不同程度的影响。具体影响取决于学校的具体要求以及毕业生的个人就业安排。

详细分析：

1. 对毕业手续的影响：

   • 毕业证书等证件的领取：部分学校将提交三方协议作为办理毕业手续的一项要求。若毕业生未按时提交，可能导致学校无法及时为其办理相关就业手续，进而影响毕业证书、学位证书等重要证件的领取，延缓毕业进程。
   • 报到证的发放：报到证是毕业生到单位报到的凭证，也是办理户口迁移、档案转接等手续的重要依据。没有三方协议，学校可能无法为毕业生出具报到证，从而影响其在用人单位的入职手续和后续权益保障。

2. 对户口和档案迁移的影响：

   • 档案派遣问题：学校通常依据三方协议上填写的用人单位信息为毕业生办理档案转递手续。若不提交三方协议，学校可能按默认方式处理档案，如将档案派回学生生源地的人才交流中心。这可能导致档案接收地与毕业生实际就业地不一致，给后续使用档案带来不便。
   • 户口迁移受限：对于希望将户口迁移到就业地的毕业生而言，三方协议是办理户口迁移手续的重要材料之一。不提交三方协议，可能无法顺利办理户口迁移，导致户口不能及时落到就业地，进而影响在当地的生活和工作，如身份证换领、购房、子女入学等事项可能会受到限制。

3. 对就业权益的影响：

   • 就业权益保障不足：三方协议具有法律效力，能够保障毕业生在就业过程中的合法权益。若不交给学校备案，一旦毕业生与用人单位发生劳动纠纷，学校可能无法及时介入协调。同时，没有学校的第三方监督，用人单位可能存在随意变更就业意向等情况，而毕业生难以通过有效途径进行约束和维权。
   • 失去就业指导和服务：学校在毕业生签订三方协议后，会持续提供就业指导和服务。不提交三方协议，学校可能无法准确掌握学生的就业动态，从而无法提供针对性的服务和支持。

4. 对学校的影响：

   • 就业统计数据不准确：学校依据三方协议统计毕业生就业情况，这是向上级教育部门汇报及评估自身就业工作成效的重要依据。不提交三方协议会导致就业统计数据不完整、不准确，影响学校整体就业情况的呈现。
   • 就业工作评估受影响：教育部门的就业工作评估基于学校的毕业生就业数据。若因部分学生未交三方协议导致就业数据不理想，可能会影响学校在就业工作方面的排名和相关荣誉评定，进而影响后续的招生情况和社会声誉。

建议与措施：

1. 了解学校要求：毕业生应首先了解学校对三方协议的具体要求，确保按照学校规定执行。不同学校可能有不同的规定和流程，因此及时与学校沟通是非常重要的。
2. 及时沟通说明：如有特殊原因无法提交三方协议，应及时与学校相关部门沟通并说明情况，以便学校给出相应处理意见。学校通常会根据学生的实际情况提供灵活的解决方案。
3. 妥善保管文件：毕业生应妥善保管好自己的三方协议和其他重要文件，避免丢失或损坏带来的麻烦。同时，在签订三方协议时，也应仔细阅读协议条款，确保自己的权益得到充分保障。

特殊情况说明：

• 对于自主创业、参加无需三方协议流程的特定项目或计划重新选择就业单位的毕业生，不交给学校三方协议可能是可行的。但在此情况下，毕业生应确保自己能够妥善处理档案转递、户口迁移等就业相关手续，以免影响后续的生活和工作。
• 如果学校明确规定必须提交三方协议作为毕业或相关手续的必要条件，而毕业生因特殊原因无法提交，应及时与学校沟通并寻求解决方案，以避免影响毕业进程和相关权益。

总之，三方协议的提交与否对毕业生和学校均具有重要意义。毕业生应根据自身情况和学校要求，合理处理三方协议的提交问题，以确保自己的权益不受损害，并顺利完成学业和就业过渡。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。