子公司可以和母公司签订工程合同，且母公司作为乙方在法律上是可行的，但需满足一定条件并注意潜在风险。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律可行性
法人独立性原则：子公司和母公司作为独立的法人实体，各自享有民事权利和承担民事义务。因此，它们之间可以签订工程合同，只要合同内容合法、双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，该合同即具有法律效力。
合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同当事人有权依法自主订立合同，任何单位和个人不得非法干预。因此，子公司和母公司作为平等的民事主体，有权自主决定是否签订工程合同以及合同的具体内容。
二、潜在风险与注意事项
关联交易风险：由于子公司和母公司之间存在关联关系，因此它们之间的交易可能被视为关联交易。如果交易价格不公允、交易条件不公平，或者存在其他损害子公司或其他股东利益的情况，可能会引发法律纠纷或监管关注。因此，在签订工程合同时，应确保交易价格公允、交易条件公平，并履行必要的审批程序和信息披露义务。
合同履行风险：在工程合同履行过程中，如果母公司（乙方）未能按照合同约定履行义务，如工期延误、工程质量不达标等，子公司（甲方）有权要求母公司承担违约责任。然而，由于双方存在关联关系，子公司可能在行使权利时受到一定限制或影响。因此，在签订合同时，应明确约定违约责任和争议解决方式，以确保在发生纠纷时能够及时、有效地维护自身权益。
税务合规风险：子公司和母公司之间的交易可能涉及税务问题，如增值税、企业所得税等。如果交易价格不公允或存在其他税务违规行为，可能会引发税务风险。因此，在签订工程合同时，应确保交易价格符合市场公允价值，并履行必要的税务申报和缴纳义务。
三、建议与措施
完善合同条款：在签订工程合同时，应详细约定工程范围、工期、质量标准、价款及支付方式、违约责任等关键条款，以确保合同内容明确、具体、可执行。
履行审批程序：如果子公司和母公司之间的交易涉及关联交易或重大事项，应按照公司章程或相关法律法规的规定履行审批程序，确保交易合法合规。
加强风险管理：在合同履行过程中，应加强风险管理，定期对工程进度、质量、价款支付等情况进行监督和检查，及时发现并解决问题，确保合同顺利履行。
寻求专业支持：在签订和履行工程合同过程中，如果遇到复杂的法律问题或风险点，建议及时咨询专业律师或相关机构，以获取专业的法律意见和支持。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。