结论：自然人借款，一般情况下不能直接判决该自然人经营的个体工商户承担偿还责任，但在特定情形下，如借款实际用于个体工商户经营等，个体工商户可能需要承担相应责任。以下从不同角度进行分析：
一、法律主体角度
自然人与个体工商户的法律地位：
- 自然人是指具有民事权利能力和民事行为能力，依法独立享有民事权利和承担民事义务的个人。
- 个体工商户则是指公民在法律允许的范围内，依法经核准登记，从事工商业经营的家庭或户，其虽然可以以字号名义进行民事活动，但本质上仍属于自然人经营的范畴，不具有独立的法人资格。
借款合同的相对性：
- 借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。根据合同的相对性原则，借款合同仅对借款人和贷款人具有法律约束力。
- 如果借款合同是由自然人与贷款人签订的，那么在没有其他约定或法定情形下，该借款合同对个体工商户不具有直接的法律约束力。
二、特定情形下的责任承担
借款实际用于个体工商户经营：
- 如果自然人借款后，将借款实际用于其经营的个体工商户的生产经营活动，且贷款人对此知情或应当知情，那么在这种情况下，可以认为个体工商户是借款的实际使用人和受益人。
- 根据公平原则和诚实信用原则，个体工商户可能需要承担相应的偿还责任。但这一责任的承担通常需要通过诉讼程序，由法院根据具体案情进行裁决。
个体工商户与自然人财产混同：
- 如果个体工商户的财产与自然人的财产混同，无法区分，那么在借款纠纷中，贷款人可能会主张个体工商户与自然人承担连带责任。
- 但这种情况下，贷款人需要承担举证责任，证明个体工商户与自然人的财产确实存在混同情况。
个体工商户作为共同借款人或担保人：
- 如果在借款合同中，个体工商户作为共同借款人或担保人签字确认，那么根据借款合同的约定，个体工商户需要承担相应的偿还责任或担保责任。
三、法律建议
对于贷款人：
- 在签订借款合同时，应明确借款人的身份和借款用途，尽量要求借款人以个体工商户的名义（如果适用）签订借款合同，并加盖个体工商户的公章或财务章。
- 如果借款实际用于个体工商户经营，应在借款合同中明确约定，并要求个体工商户提供相应的担保或保证。
对于自然人借款人：
- 应明确借款用途，避免将借款用于个体工商户经营以外的其他用途，以免引发不必要的法律纠纷。
- 如果确实需要将借款用于个体工商户经营，应与贷款人明确约定，并考虑让个体工商户作为共同借款人或担保人参与借款合同。
对于个体工商户：
- 应建立健全的财务管理制度，确保个体工商户的财产与自然人的财产相互独立，避免财产混同情况的发生。
- 在参与借款活动时，应谨慎评估借款风险，并根据实际情况决定是否作为共同借款人或担保人参与借款合同。
后续行动建议：如果您面临此类纠纷，建议收集相关证据，如借款合同、转账记录、借款用途证明等，以便在诉讼中维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。