公司每两年更换一次法人代表，这一行为本身并不违法，但需确保更换过程符合《公司法》及相关法规要求，并妥善处理可能涉及的税务、合同等后续问题。以下从多个角度为你详细分析：

一、法人代表更换的合法性

1. 公司自治原则：根据《公司法》第十三条，公司法定代表人依照公司章程的规定，由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。公司有权根据自身需要，通过修改公司章程或股东会决议等方式，更换法定代表人。因此，每两年更换一次法人代表，只要符合公司章程和法律规定，就是合法的。

2. 程序合规性：更换法定代表人需遵循法定程序，包括召开股东会或董事会形成决议、修改公司章程（如需）、办理工商变更登记等。若程序不合法，可能导致更换行为无效，甚至引发法律纠纷。

二、更换法人代表的注意事项

1. 税务问题：

   • 税务登记变更：根据《税务登记管理办法》第十六条，纳税人税务登记内容发生变化的，应自工商行政管理机关或者其他机关办理变更登记之日起30日内，持有关证件向原税务登记机关申报办理变更税务登记。更换法定代表人后，需及时办理税务登记变更手续，避免税务风险。
   • 税务责任转移：原法定代表人在任职期间可能产生的税务责任，不会因更换法定代表人而自动转移。新法定代表人需了解公司税务状况，确保公司税务合规。

2. 合同问题：

   • 合同履行：更换法定代表人不影响公司已签订合同的履行。新法定代表人需继续履行原法定代表人签订的合同，避免违约风险。
   • 合同签署：新法定代表人有权代表公司签署新合同，但需确保合同内容合法、合规，并符合公司利益。

3. 公司治理问题：

   • 公司章程修改：若公司章程中规定了法定代表人的任职期限或更换条件，更换时需修改公司章程并办理备案手续。
   • 股东会或董事会决议：更换法定代表人需形成有效的股东会或董事会决议，并确保决议内容合法、合规。

三、潜在风险及防范

1. 法律风险：若更换程序不合法或未及时办理相关变更登记手续，可能面临行政处罚或法律纠纷。建议严格按照法定程序操作，并保留好相关决议、变更登记文件等证据。

2. 信誉风险：频繁更换法定代表人可能影响公司信誉和合作伙伴的信任。建议公司在更换法定代表人前，充分评估更换的必要性，并做好沟通解释工作。

3. 内部管理风险：更换法定代表人可能导致公司内部管理混乱或权力交接不畅。建议制定详细的交接计划，确保公司运营平稳过渡。

四、建议与总结

1. 建议：若公司确实需要每两年更换一次法人代表，建议制定完善的更换制度，明确更换条件、程序和责任分工，确保更换过程合法、合规、有序。
2. 总结：公司每两年更换一次法人代表并不违法，但需确保更换过程符合法律规定和公司章程要求，并妥善处理税务、合同等后续问题。如有任何疑问或需要进一步帮助，请随时向我咨询。