运输船走私，其违法所得及用于走私的运输工具确实有可能被没收。以下是对此问题的详细分析：
一、走私行为的法律定性
走私行为违反了国家对进出口货物、物品的管理制度，破坏了市场经济秩序，因此受到法律的严厉打击。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，走私行为可能构成走私普通货物、物品罪，走私国家禁止进出口的货物、物品罪，走私珍贵动物、珍贵动物制品罪等多种罪名。
二、没收走私运输船的法律依据
《中华人民共和国刑法》第六十四条：
- 法规原文：犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。
- 分析：在走私案件中，运输船作为供犯罪所用的本人财物，如果被认定为走私工具，那么根据该条款，运输船是有可能被没收的。
《中华人民共和国海关法》第八十二条：
- 法规原文：违反本法及有关法律、行政法规，逃避海关监管，偷逃应纳税款、逃避国家有关进出境的禁止性或者限制性管理，有下列情形之一的，是走私行为：……（四）运输、携带、邮寄国家禁止或者限制进出境货物、物品或者依法应当缴纳税款的货物、物品进出境的；……有前款所列走私行为之一，尚不构成犯罪的，由海关没收走私货物、物品及违法所得，可以并处罚款；专门或者多次用于掩护走私的货物、物品，专门或者多次用于走私的运输工具，予以没收，藏匿走私货物、物品的特制设备，责令拆毁或者没收。
- 分析：该条款明确规定了走私行为的定义，并指出对于专门或者多次用于走私的运输工具，海关有权予以没收。这意味着，如果运输船被认定为专门或多次用于走私，那么它将被没收。
三、没收走私运输船的实践应用
在司法实践中，海关和司法机关会根据走私行为的严重程度、运输船在走私中的作用以及运输船的所有权情况等因素，综合判断是否对运输船进行没收。如果运输船是走私者专门用于走私活动的，或者走私行为情节严重，那么运输船被没收的可能性就较大。
四、法律建议
对于走私者：
- 走私行为是违法的，不仅可能导致运输船被没收，还可能面临刑事处罚。因此，建议走私者立即停止走私行为，并主动向海关或司法机关投案自首，以争取从轻处理。
对于运输船所有者或经营者：
- 如果运输船被用于走私活动，所有者或经营者可能面临法律责任。因此，建议所有者或经营者加强对运输船的管理和监督，确保运输船不被用于违法活动。同时，如果发现运输船被用于走私，应立即向海关或司法机关报告，并配合调查和处理工作。
对于一般公众：
- 走私行为破坏了市场经济秩序和国家安全，因此公众应增强法律意识，不参与走私活动，也不为走私活动提供便利条件。如果发现走私行为，应及时向海关或司法机关举报。
综上所述，运输船走私确实有可能被没收。这取决于走私行为的严重程度、运输船在走私中的作用以及相关法律法规的规定。如果你或你身边的人涉及走私问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。