结论：村集体组织无房屋权属证明时，在一定条件下仍然可以起诉排除妨害，但需结合具体情况和证据来综合判断。

分析说明：

1. 排除妨害的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，妨害物权或者可能妨害物权的，权利人可以请求排除妨害或者消除危险。这是村集体组织起诉排除妨害的基本法律依据。

2. 无房屋权属证明的情况：

   • 房屋权属证明是证明房屋所有权的重要文件，但并非起诉排除妨害的唯一依据。在缺乏房屋权属证明的情况下，村集体组织可以通过其他证据来证明其对房屋享有合法权益，如历史沿革、使用情况、相关政府文件或决定等。
   • 如果村集体组织能够提供充分证据证明其对房屋享有管理、使用或收益等权益，且这些权益受到妨害，那么即使没有房屋权属证明，也有权起诉要求排除妨害。

3. 起诉排除妨害的条件：

   • 村集体组织需要证明其对房屋享有合法权益，且这些权益受到妨害。
   • 妨害行为必须是现实存在的，且对村集体组织的合法权益造成了实际损害或可能造成损害。
   • 村集体组织需要提供足够的证据来支持其主张，包括但不限于历史文件、使用记录、证人证言等。

4. 实际操作中的建议：

   • 在起诉前，村集体组织应尽可能收集相关证据，以证明其对房屋享有合法权益和妨害行为的存在。
   • 如果可能的话，可以尝试与妨害方进行协商，寻求和解或调解的方式解决纠纷，以节省时间和成本。
   • 如果协商无果，村集体组织应及时向法院提起诉讼，并准备好相关证据材料，以维护其合法权益。

行动建议：

• 村集体组织应尽快收集能够证明其对房屋享有合法权益的相关证据，如历史文件、使用记录、政府决定等。
• 在收集证据的过程中，村集体组织可以咨询专业律师的意见，以确保证据的充分性和有效性。
• 如果决定起诉排除妨害，村集体组织应准备好起诉状和相关证据材料，并及时向法院提交。

特殊场景提醒：

• 如果房屋权属存在争议或历史遗留问题较为复杂，村集体组织在起诉前应充分考虑诉讼风险和成本，并谨慎决策。
• 在诉讼过程中，村集体组织应积极配合法院的调查和审理工作，及时提供相关证据和材料，以维护其合法权益。

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