已确权的土地承包经营权存在争议时，可通过协商、调解、行政处理、仲裁或诉讼等途径解决。具体处理方式如下：

1. 协商解决
   争议双方可自行协商，通过友好沟通达成一致意见，重新明确土地承包经营权的归属或使用方式。协商需基于自愿原则，结果可通过书面协议固定，避免后续纠纷。若协商成功，可节省时间和成本，且灵活性较高。

2. 调解处理
   若协商未果，可申请第三方调解。调解主体包括村委会、乡镇人民政府或农村土地承包仲裁机构等。调解需遵循公平、公正原则，调解协议经双方签字后具有法律效力。调解的优势在于程序简便，且能维护邻里关系，但调解结果不具有强制执行力，若一方反悔仍需通过其他途径解决。

3. 行政处理
   根据《农村土地承包法》，县级以上地方人民政府农业农村、林业和草原等主管部门有权处理土地承包经营权争议。当事人可向相关部门提交书面申请，说明争议事实、理由及诉求。行政处理程序相对正式，处理结果具有行政效力，若一方不服可提起行政诉讼。

4. 仲裁或诉讼

   • 仲裁：若双方在承包合同中约定了仲裁条款，或事后达成仲裁协议，可向农村土地承包仲裁委员会申请仲裁。仲裁裁决具有终局性，一方不履行可申请法院强制执行。
     
   • 诉讼：若未约定仲裁，可直接向法院提起民事诉讼。法院将根据证据和法律规定判决土地承包经营权的归属。诉讼程序严格，但判决结果具有强制执行力，是解决争议的最终途径。

建议：处理争议时，需保留土地承包合同、确权证书、缴费凭证等相关证据，以支持自身主张。若争议复杂或涉及金额较大，建议及时咨询专业律师，确保权益得到充分保障。