当因确认农村土地承包经营权发生纠纷时，您可以根据纠纷的具体情况和性质，选择以下一种或多种途径来处理：

一、协商解决（推荐首选）

适用情况：纠纷情节较轻、双方关系较好且争议不大的情况，如土地边界轻微模糊、历史原因导致的土地使用方式小分歧等。

具体做法：

1. 当事人自行协商：双方本着互谅互让、平等协商的原则，直接进行沟通交流，尝试达成一致的解决方案。
2. 请求第三方协助协商：可以邀请村里有威望的长辈、家族代表、村干部或乡镇政府工作人员作为中间人参与协商，帮助双方梳理问题、理清思路，促使双方达成和解协议。

优势：协商解决具有灵活性高、成本低、效率高、不伤和气的优点，能够快速解决纠纷，维护邻里关系的和谐稳定。

二、行政调解

适用情况：协商无法达成一致时，或涉及土地面积测量误差较大、土地承包经营权流转过程中产生的复杂矛盾等情况。

具体做法：向当地乡镇人民政府或县级以上人民政府的土地管理部门提出调解申请。相关部门会安排工作人员对纠纷进行调查了解，收集相关证据材料，组织双方当事人进行调解，提出合理的解决方案，促使双方达成调解协议。

优势：行政调解具有一定的权威性和专业性，行政机关能够依据相关法律法规和政策，为纠纷解决提供准确的法律依据和指导，其调解结果也更容易得到双方的认可和执行。

三、申请仲裁

适用情况：主要适用于农村土地承包经营纠纷，如承包期限、承包费用、土地用途变更等问题引发的纠纷，或协商、调解无果的情况。

具体做法：

1. 提交仲裁申请：根据事先达成的仲裁协议或在纠纷发生后达成的书面仲裁协议，向农村土地承包仲裁委员会申请仲裁。
2. 仲裁程序：仲裁委员会会按照法定程序受理案件，组成仲裁庭进行审理，并作出仲裁裁决。

优势：仲裁具有专业性强、一裁终局的特点。仲裁员通常具备丰富的农业知识和法律知识，能够准确把握纠纷的关键问题，公正地作出裁决。而且仲裁裁决一经作出即发生法律效力，当事人不得再就同一纠纷向人民法院提起诉讼，这有助于提高纠纷解决的效率。

四、提起诉讼

适用情况：如果其他途径都无法解决纠纷，或者当事人对行政裁决、仲裁结果不满意，可以选择通过诉讼的方式解决。如涉及土地确权的重大法律问题，或纠纷金额巨大、影响广泛的情况。

具体做法：

1. 准备诉讼材料：包括起诉状、相关证据等，明确诉讼请求和事实理由。
2. 向人民法院提起诉讼：向有管辖权的人民法院（一般是被告住所地或者合同履行地的人民法院）提交诉讼材料，法院将依法受理案件，并按照法定程序进行审理。
3. 参与庭审：遵守诉讼程序，按时参加庭审，积极举证、质证，配合法院的审理工作。

优势：司法审判具有最高的权威性和最终性。法院的判决具有强制执行力，能够为当事人的合法权益提供最有力的保障。同时，司法程序严格规范，能够确保纠纷得到公正、公平的解决。

总结与建议

在处理农村土地承包经营权纠纷时，建议您优先考虑协商和调解等非诉讼方式，以维护双方的合法权益和农村社会的稳定和谐。若协商和调解无果，可依法向农村土地承包仲裁机构申请仲裁；对仲裁结果不满意或仲裁委员会不予受理时，再向人民法院提起诉讼。在整个过程中，请务必了解相关法律法规和政策规定，遵循法定程序，确保自身权益得到有效保护。