针对您提出的“新能源车停到地下车库，签定安全协议是否合法”的问题，我们可以从多个角度进行详细分析。

首先，从法律层面来看，我国现行有效的规范性文件并没有对新能源车停放地下车库作出限制性规定。车主驾驶经车辆行政管理部门依法许可行驶的新能源车辆进入地下车库，是自由行使物权的常见形式。在没有紧迫的、现实的安全隐患和消防义务的情况下，酒店或商场等场所禁止新能源车进入地下车库，缺乏明确、充分的事实依据，也不具有正当性，这实际上对车主正常行使物权构成了妨碍。

其次，从消费者权益保护的角度来看，新能源车主到酒店或商场地下车库停车，属于消费者购买停车管理服务的行为。根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定，经营者向消费者提供商品或者服务时，应当恪守社会公德，诚信经营，保障消费者的合法权益，不得设定不公平、不合理的交易条件，也不得强制交易。因此，如果酒店或商场以安全为由禁止新能源车停放地下车库，而未能提供充分、合理的解释和依据，那么这种行为可能构成对消费者合法权益的侵犯，即消费歧视。

至于您提到的“签定安全协议”的问题，这实际上是一种风险管理和责任划分的手段。然而，仅仅通过签定安全协议，并不能完全解决新能源车停放地下车库的合法性问题。因为合法性的核心在于是否违反了法律法规的强制性规定，以及是否侵犯了消费者的合法权益。如果酒店或商场要求新能源车车主签定安全协议作为停放地下车库的条件，但这种要求缺乏法律依据或构成消费歧视，那么这种协议可能是无效的。

最后，关于安全事故的责任划分问题，如果新能源汽车在停放过程中发生燃烧等安全事故，应由消防部门根据实际调查情况认定火灾事故原因以确定责任主体。这可能包括新能源车主、车企、电池供应商或物业管理单位等，具体取决于事故原因和责任归属。

综上所述，新能源车停到地下车库并签定安全协议本身并不直接决定其合法性。合法性的关键在于是否违反了法律法规的强制性规定，以及是否侵犯了消费者的合法权益。因此，建议酒店或商场等场所在进行新能源车停放管理时，应充分考虑法律法规的要求和消费者的合法权益，采取科学合理的管理措施，而非简单地以签定安全协议或禁止停放等方式来应对。