结论前置：
- 一般情况下，自来水公司无权因个别住户长期拖欠水费而断整个小区的自来水。
- 但在特定情况下，如合同中有明确约定或法律有特别规定，自来水公司可能采取一定措施，但通常也需遵循法定程序，不能直接断水。
详细分析：
一、一般情况下的法律原则
在大多数情况下，自来水公司作为公共服务提供者，其服务对象是整个小区或特定区域的居民，而非单个住户。因此，当小区内有住户长期拖欠水费时，自来水公司通常不能直接对整个小区断水。这是因为：
- 公共利益保护：断水会影响整个小区居民的正常生活，包括那些按时缴纳水费的住户，这违背了公共利益保护的原则。
- 合同相对性：自来水公司与小区或物业之间通常签订有供水合同，合同双方应各自履行义务。住户拖欠水费是住户与自来水公司（或通过物业代收）之间的债权债务关系，不应影响其他住户的用水权益。
二、特定情况下的法律考量
尽管在一般情况下自来水公司不能直接断水，但在某些特定情况下，自来水公司可能采取一定措施来追讨欠费，但这些措施通常也需遵循法定程序：
- 合同约定：如果供水合同中明确约定了，在住户拖欠水费达到一定金额或期限时，自来水公司有权采取包括断水在内的措施，并且这一约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么自来水公司可能在一定程度上享有断水的权利。但即便如此，断水前也应履行相应的通知义务，并给予欠费住户合理的缴费期限。
- 法律特别规定：在某些特殊情况下，如住户恶意拖欠水费且数额巨大，严重影响自来水公司的正常运营，且法律、行政法规对此有特别规定时，自来水公司可能通过法律途径申请断水。但这种情况较为罕见，且需严格遵循法定程序。
三、实际操作中的建议
- 对于自来水公司：在面对住户拖欠水费的情况时，应首先通过合法途径追讨欠费，如发送催缴通知、提起民事诉讼等。在采取任何可能影响其他住户用水权益的措施前，应确保符合合同约定和法律规定，并履行相应的通知和告知义务。
- 对于小区物业和住户：物业应积极协助自来水公司追讨欠费，同时加强与住户的沟通，了解欠费原因并寻求解决方案。住户则应按时缴纳水费，避免产生不必要的纠纷和损失。
四、法律后果
如果自来水公司未经合法程序擅自断水，可能面临以下法律后果：
- 行政责任：可能因违反相关行政法规而受到行政处罚。
- 民事责任：需对因此给其他住户造成的损失承担赔偿责任。
总结与建议：
小区有住户长期拖欠水费时，自来水公司通常无权直接断整个小区的自来水。在处理此类问题时，应遵循合同约定和法律规定，通过合法途径追讨欠费，并确保不损害其他住户的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。