关于三方协议是否可以学校先盖章的问题，这并非一个绝对固定的流程，而是可以根据实际情况和学校的管理规定来灵活处理的。不过，我可以为您详细解释一下三方协议的签订流程以及学校盖章的重要性，帮助您更好地理解这个问题。

首先，三方协议，即《全国普通高等学校毕业生就业协议书》，是毕业生、用人单位和学校三方就毕业生就业事项达成的书面约定。它明确了各方在毕业生就业工作中的权利和义务，对于保障毕业生的权益、确认毕业生的资质以及用人单位的录用决策都具有重要意义。

在签订三方协议的过程中，学校盖章是一个重要的环节。学校盖章不仅为协议增添了官方认证，提高了协议的公信力和法律效力，还体现了学校对协议内容的认可及愿意履行相关职责的承诺。同时，学校盖章也是对毕业生身份、学历等信息的真实性和有效性的证明，有助于用人单位放心录用。

关于学校盖章的顺序，虽然民法典并未明确规定学校盖章的具体顺序，但在实际操作中，为了确保协议的合法性和有效性，以及更好地维护毕业生的利益，通常建议按照以下流程进行：

1. 毕业生与用人单位进行充分沟通，了解岗位信息，并获取三方协议模板。
2. 毕业生如实填写个人信息后，提交给用人单位审核，并由其在协议上加盖公章或合同专用章。
3. 用人单位盖章后，毕业生将协议带回学校进行审核。学校相关部门在确认协议内容合法、各方意思表示真实后，进行盖章确认。

当然，也存在一些特殊情况，如实习性质的简单协议或双方有明确约定且不涉及学校职责的协议，可能不需要学校盖章即有效。但对于正规的、涉及毕业生正式就业并需要学校履行相应职责的三方协议，建议遵循上述正规流程完成学校盖章。

总的来说，虽然学校在三方协议上可以先盖章，但这并不改变协议的法律效力。关键在于确保协议内容的合法性和真实性，并严格按照法律、行政法规的规定以及学校的管理要求办理相关手续。为了维护毕业生的利益，建议遵循正常的签约程序进行，即先由用人单位盖章，再由学校盖章确认。