结论：当电动车在交通事故中被判定为负次要责任时，电动车主确实需要赔付摩托车相应比例的维修费用。以下是对此问题的详细解析：

1. 法律依据与责任划分

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例，交通事故的责任划分是由交警部门根据事故现场情况、双方行为及过错程度等因素综合判定的。若电动车被判定为次要责任，那么它就需要按照责任比例承担相应的赔偿责任。
   • 具体的责任比例通常会在交通事故责任认定书中明确，比如电动车承担30%责任，摩托车承担70%责任等。这意味着，电动车主需要赔付摩托车维修费用的30%（假设的责任比例，实际比例以责任认定书为准）。

2. 定损与赔偿流程

   • 确定损失：摩托车主应将车辆送至正规维修店进行定损，明确维修所需的具体费用，并保留好维修清单、发票等相关凭证。
   • 协商赔偿：基于责任认定书，双方应就赔偿事宜进行协商。电动车主可以根据责任比例向摩托车主支付相应的维修费用。如果电动车购买了交强险或商业第三者责任险，那么可以通过保险公司进行理赔。
   • 保险理赔：若电动车购买了相关保险，电动车主应及时向保险公司报案，并按照保险公司的要求提供相关证据和凭证。保险公司会根据保险合同中的约定和责任比例来进行赔付。

3. 特殊情况与争议解决

   • 特殊情况：如果摩托车主对定损结果有异议，或者双方对责任比例有争议，那么可能需要通过第三方机构进行评估或重新认定责任。
   • 争议解决途径：如果双方在赔偿问题上无法达成一致，可以选择调解或诉讼等途径来解决纠纷。调解可以请求公安机关交通管理部门进行，诉讼则可以向人民法院提起。

4. 法律建议

   • 保留证据：在整个过程中，确保保留好所有相关证据和凭证是至关重要的，包括交通事故责任认定书、维修清单、发票、保险单等。
   • 及时沟通：双方应保持沟通，尽量通过协商解决问题，以减少不必要的纠纷和损失。
   • 寻求专业帮助：如果对法律程序或赔偿计算有疑问，可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到妥善维护。

示例说明：假设一辆电动车与一辆摩托车发生交通事故，交警部门判定电动车承担30%的责任，摩托车承担70%的责任。摩托车的维修费用为1000元，那么电动车主就需要赔付摩托车主300元（1000元 * 30%）。如果电动车购买了交强险或商业第三者责任险，并且保险金额足够覆盖这部分赔偿，那么电动车主可以通过保险公司进行理赔。

希望以上解析能对你有所帮助。如果你有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。