医疗机构执业许可证本身不能作为处罚主体，但持有该许可证的医疗机构若存在违法行为，则该机构会成为处罚对象。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

一、法律主体与处罚对象

1. 法律主体：在法律上，主体通常指的是具有法律权利和承担法律义务能力的实体。医疗机构执业许可证是医疗机构合法执业的凭证，但它本身并不具备法律主体的资格。真正的法律主体是持有该许可证的医疗机构，如医院、诊所等。

2. 处罚对象：当医疗机构存在违法行为时，如未取得许可证擅自执业、许可证过期后继续执业、出卖转让出借许可证等，卫生行政部门将依法对医疗机构进行处罚，而不是对许可证本身进行处罚。

二、具体违法行为及处罚

1. 未取得许可证擅自执业：

   • 根据《中华人民共和国基本医疗卫生与健康促进法》第九十九条，未取得医疗机构执业许可证擅自执业的，由县级以上人民政府卫生健康主管部门责令停止执业活动，没收违法所得和药品、医疗器械，并处违法所得五倍以上二十倍以下的罚款，违法所得不足一万元的，按一万元计算。

2. 许可证过期后继续执业：

   • 医疗机构执业许可证过期后仍继续执业，同样属于违法行为。卫生行政部门将责令其停止执业活动，并可能根据情节轻重，采取没收非法所得、罚款乃至吊销执业许可证等处罚措施。

3. 出卖、转让、出借许可证：

   • 根据《医疗机构管理条例》第四十六条，医疗机构出卖、转让、出借《医疗机构执业许可证》的，由县级以上人民政府卫生行政部门没收非法所得，并可以处以罚款；情节严重的，吊销其《医疗机构执业许可证》。

三、处罚流程与注意事项

1. 处罚流程：

   • 卫生行政部门在查处医疗机构违法行为时，通常遵循立案、调查取证、告知与听证、决定与送达、执行与监管等流程。
   • 在作出行政处罚决定前，会告知当事人相关事实和依据，并保障其陈述申辩、听证等权利。

2. 注意事项：

   • 医疗机构应严格遵守国家法律法规，确保执业许可证在有效期内并及时办理续期手续。
   • 卫生行政部门应加强监管力度，对违法违规行为进行严厉打击，以切实保障公众的健康权益。

四、案例警示

以某基层医疗机构为例，该机构为谋取经济利益，将其《医疗机构执业许可证》出借给一家未取得合法资质的诊所。后经卫生行政部门查处，该医疗机构不仅被没收非法所得，还被处以罚款，并且其《医疗机构执业许可证》也被吊销。此案例深刻警示了医疗机构必须合法执业，不得出卖、转让、出借执业许可证。

总结与建议：医疗机构执业许可证是医疗机构合法执业的凭证，但它本身不能作为处罚主体。当医疗机构存在违法行为时，卫生行政部门将依法对医疗机构进行处罚。因此，医疗机构应严格遵守国家法律法规，确保合法执业；同时，卫生行政部门也应加强监管力度，对违法违规行为进行严厉打击。如果您在医疗医患领域有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。