在夫妻起诉离婚的情况下，法院在特定条件下确实可能会查询双方的资金流水，但并非所有离婚案件都会进行此项调查。以下是对此问题的详细分析：
一、可能查询资金流水的情形
一方提出财产分割请求并怀疑对方有不当行为：
- 如果一方在离婚诉讼中提出了对另一方名下财产的分割请求，并怀疑对方存在隐瞒、转移或挥霍夫妻共同财产的行为，法院为了查明事实真相，可能会要求双方提供资金流水作为证据。例如，若一方发现对方有大额资金异常转出且无法说明合理用途，或存在其他隐匿财产的嫌疑，此时资金流水就成为关键证据。
涉及大额财产争议：
- 在涉及大额财产争议的离婚案件中，如房产、车辆、存款等，法院为了准确界定夫妻共同财产的范围和价值，可能会调取双方的资金流水以核实资金流向和交易记录。这有助于法院更公正地分割夫妻共同财产。
一方有隐藏、转移财产嫌疑：
- 如果一方被怀疑在婚姻关系存续期间有隐藏、转移、变卖、毁损夫妻共同财产的行为，法院有权根据当事人的申请或依职权调查取证，包括调取资金流水。这是为了保护另一方的合法权益，防止财产被非法转移或隐匿。
二、查询资金流水的程序和要求
当事人申请：
- 一般情况下，需要由当事人向法院提出申请，说明需要查询资金流水的理由和目的。申请时，应尽可能提供对方的银行账号、开户银行、大致时间段等相关线索，以便法院更高效地调取证据。
法院审查：
- 法院会对当事人的申请进行审查，认为有必要的才会批准调取资金流水。审查时，法院会考虑申请是否合理、是否与案件紧密相关、是否侵犯对方合法权益等因素。
依法调取：
- 法院会依法向相关银行发出协助查询通知书，要求银行提供指定账户在一定时间段内的交易明细。银行在收到法院的协助查询通知书后，有义务配合法院提供相关证据。
保密义务：
- 银行和法院都有义务对调取的资金流水信息予以保密，不得泄露给无关人员。这是为了保护当事人的隐私权，防止信息被滥用。
三、注意事项与建议
综合证据链：
- 资金流水作为单一证据可能不足以充分证明当事人的主张，应结合其他证据（如聊天记录、转账凭证等）共同形成完整的证据链。这有助于增强证据的证明力，提高胜诉的可能性。
尊重隐私权：
- 当事人在申请查询资金流水时，应尊重对方的隐私权，不得滥用查询权利。查询应仅限于与案件相关的必要信息，避免侵犯对方的合法权益。
及时咨询与准备：
- 在离婚过程中，如果怀疑对方存在隐藏、转移财产等行为，应及时咨询专业律师（即我本人），了解相关法律程序和要求。同时，应提前收集相关证据，如银行账号、转账记录等，以便在诉讼中更好地维护自己的合法权益。
总结来说，夫妻起诉离婚时，法院在特定条件下可能会查询双方的资金流水。这主要取决于离婚方式、案件的具体情况以及当事人的诉求。如果双方能就财产分割等问题达成一致意见，且无隐藏、转移财产等指控，通常不会查询。但若存在争议或指控，法院可能会进行调查。因此，在离婚过程中，建议双方坦诚相待，协商解决财产问题；若需诉讼，则应及时咨询并准备相关证据。