结论：和公司签协议之后跑路是否需要赔违约金，这主要取决于协议中的具体约定以及跑路行为是否构成违约。以下从不同角度进行分析：
一、协议中有明确违约金条款
若跑路行为构成违约：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果协议中明确约定了违约金，并且你的跑路行为（如擅自离职、未履行合同义务等）构成了违约，那么公司有权要求你按照协议约定支付违约金。
- 违约金数额：通常会在协议中明确约定，如果约定的违约金过高或过低，双方可以协商调整，或者通过法律途径请求法院或仲裁机构予以增减。
若跑路行为不构成违约：
- 如果协议中没有明确将你的跑路行为定义为违约，或者存在某些免责条款（如不可抗力、公司违约在先等），那么你可能不需要支付违约金。
- 但这种情况下，你需要有充分的证据来证明你的跑路行为并非出于故意或恶意，且符合免责条件。
二、协议中没有明确违约金条款
若跑路行为给公司造成损失：
- 即使协议中没有明确约定违约金，如果你的跑路行为给公司造成了实际损失（如招聘成本、培训成本、业务中断损失等），公司仍然有权要求你赔偿这些损失。
- 赔偿范围：通常限于实际损失，且需要公司能够提供充分的证据来证明这些损失的存在和数额。
若跑路行为未给公司造成损失：
- 如果你的跑路行为并未给公司造成实际损失，或者公司无法证明存在损失，那么公司可能无法要求你赔偿。
三、特殊情况考虑
协议效力问题：
- 如果协议本身存在无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫、显失公平等），那么协议中的违约金条款也可能无效或可撤销。
- 在这种情况下，你需要通过法律途径来确认协议的效力，并据此决定是否需要支付违约金。
公司行为影响：
- 如果公司在你跑路前存在违约行为（如未按时支付工资、未提供约定的工作条件等），这可能影响你违约责任的承担。
- 在这种情况下，你可以主张公司先违约，从而减轻或免除自己的违约责任。
建议：
- 仔细审查协议：首先，你需要仔细审查与公司的协议，了解其中关于违约金的约定以及违约的定义和范围。
- 收集证据：如果你认为自己的跑路行为不构成违约或存在免责情形，你需要收集相关证据来支持自己的主张。
- 协商解决：在可能的情况下，你可以尝试与公司协商解决纠纷，以避免法律诉讼带来的时间和成本消耗。
- 寻求法律帮助：如果你对协议条款、违约责任或赔偿范围存在疑问，或者无法与公司达成一致意见，建议及时向我咨询，以便更好地维护自己的合法权益。