若认为民事判决中存在原告不合格的情形，可通过以下步骤申请再审：

1. 明确再审申请的法律依据
   根据《民事诉讼法》第207条，当事人认为已生效判决存在“原判决、裁定认定事实的主要证据不足”“适用法律确有错误”或“违反法定程序可能影响案件正确判决”等情形时，可申请再审。其中，“原告不合格”可能涉及主体资格问题（如原告与案件无直接利害关系），属于“认定事实错误”或“适用法律错误”的范畴，符合再审申请条件。

2. 准备再审申请材料

   • 再审申请书：需写明申请人基本信息、原审判决信息、再审请求（如撤销原判、改判或发回重审）、事实与理由（重点说明原告主体资格为何不合格，如原告与案件无直接利害关系、原告主体已消灭等），并附相关证据（如原告主体资格证明文件、生效法律文书等）。
     
   • 原审判决书：提供生效判决的复印件或电子版。
     
   • 证据材料：包括证明原告不合格的新证据（如原告主体资格变更的工商登记、原告与案件无利害关系的合同或协议等），或原审未质证但能证明原告不合格的证据。
     

3. 确定再审申请的管辖法院
   根据《民事诉讼法》第206条，再审申请应向作出生效判决的上一级法院提出。例如，若原判决由基层法院作出，则向中级法院申请再审；若由中级法院作出，则向高级法院申请。

4. 提交再审申请并等待审查
   将准备好的材料提交至管辖法院的立案庭或再审审查部门。法院会在收到申请后3个月内审查，符合条件的裁定再审，不符合的裁定驳回。审查期间，法院可能要求补充材料或组织听证，需积极配合。

5. 再审程序中的注意事项

   • 时效限制：再审申请应在判决生效后6个月内提出，但若因“原告不合格”等新证据出现，可自知道或应当知道之日起6个月内提出。
     
   • 证据效力：新证据需满足“客观性、关联性、合法性”，且能直接证明原告不合格，否则可能被法院排除。
     
   • 代理建议：再审程序复杂，建议委托律师协助撰写申请书、整理证据及参与听证，以提高成功率。

示例场景：若原告在起诉时已注销登记（无诉讼主体资格），但原审未审查此问题，再审时可提交工商注销证明作为新证据，主张原判认定原告资格错误，要求撤销判决。

如有具体案件细节或证据材料，可进一步向我咨询，我会结合实际情况提供更精准的建议。