上交枪支是否会有案底，需根据具体情况来判断。以下从合法持有和非法持有两个角度，为您详细分析：
一、合法持有的枪支上交
不存在违法行为：
- 若您曾因特定职业、历史原因等合法持有枪支，后因政策调整或不再具备持有条件，按规定主动将枪支上交相关部门，此行为合法合规，不会留下案底。这是您积极配合国家管理规定的正当行为，无违法犯罪事实。
存在轻微违法行为：
- 如您的持枪证件过期未及时续期，但在意识到问题后主动上交枪支并说明情况，由于情节显著轻微且及时改正，未造成危害后果，根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十三条，通常不予行政处罚，因此也不会留下案底。
二、非法持有的枪支上交
主动上交且情节较轻：
- 若您非法持有枪支后主动上交，且司法机关认定您构成自首、立功等从轻、减轻或免除处罚的情节，根据相关法律及司法解释，如最终法院判定免除处罚，则不会留下案底。例如，您因不懂法而私自藏匿枪支，后通过法律宣传了解严重性并主动上交，法院可能综合考虑自首情节和社会危害性等因素作出免除处罚的判决。
情节严重的情况：
- 若您非法持有枪支行为情节严重，如持有多支枪支、利用枪支进行违法犯罪活动等，即使后来上交，也可能被追究刑事责任，从而留下案底。例如，您长期非法持有多支枪支并威胁他人生命安全，后在公安机关追捕下才上交，已构成严重犯罪，必将留下案底。
三、法律责任与宽大处理
- 根据《中华人民共和国刑法》第一百二十八条，非法持有、私藏枪支、弹药的行为将受到法律处罚。然而，主动上交枪支是遵守法律法规、配合公安机关工作的表现，有助于维护社会治安和公共安全。
- 《中华人民共和国刑法》第六十七条规定了自首可以从轻或减轻处罚的情形。您捡到枪支后主动上交并如实向公安机关说明情况，可视为积极的、与法律合作的态度，在某些情况下可能被视为类似于自首的行为，从而在法律上获得一定的宽大处理。
总结与建议：
主动上交枪支是积极的行为，通常不会因此留下案底。但涉及非法行为时，应积极配合公安机关调查，并承担相应的法律责任。在处理枪支问题时，您应始终遵守法律法规，确保自身行为的合法性。如果您对上交枪支的具体流程或法律后果有疑问，或者您面临类似的情况需要法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。