使用假证被用人单位保管这一行为本身不直接涉及追诉期问题，但若该行为后续引发了相关违法犯罪行为（如使用虚假身份证件罪等），则需根据具体罪名来确定追诉期。以下从不同角度为你详细分析：

从使用假证行为本身来看

使用假证这一行为，如果尚未构成犯罪，只是违反了《中华人民共和国治安管理处罚法》等相关行政法规，那么不存在追诉期的概念。行政处罚的时效一般是两年，即违法行为在两年内未被发现的，不再给予行政处罚，但这里说的是行政处罚的时效，并非追诉期。如果用人单位保管了假证，后续发现员工使用假证，用人单位可以依据内部规章制度进行处理，比如解除劳动合同等，同时也可以向公安机关报案，由公安机关根据具体情况进行调查处理。

从可能构成的犯罪来看

如果使用假证的行为构成了犯罪，比如使用虚假身份证件罪。根据《中华人民共和国刑法》第八十七条规定，犯罪经过下列期限不再追诉：

1. 法定最高刑为不满五年有期徒刑的：经过五年不再追诉。使用虚假身份证件罪一般处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。所以对于该罪，一般情况下追诉期是五年，如果情节严重，法定最高刑为七年以上有期徒刑的，追诉期是十年。
2. 追诉期的计算起点：追诉期限从犯罪之日起计算；犯罪行为有连续或者继续状态的，从犯罪行为终了之日起计算。在追诉期限以内又犯罪的，前罪追诉的期限从犯后罪之日起计算。例如，员工使用假证入职后，在后续工作中又利用假证进行了其他违法犯罪活动，那么使用假证犯罪的追诉期就要从进行其他违法犯罪活动之日起重新计算。

从用人单位保管假证的角度

用人单位保管假证这一行为本身，如果没有其他违法犯罪意图或行为，一般不涉及追诉期问题。但如果用人单位明知是假证而继续使用该员工从事某些特定工作，或者与员工共同利用假证进行违法犯罪活动，那么用人单位也可能构成共同犯罪，此时同样要根据具体罪名来确定追诉期。

建议你：如果遇到使用假证被用人单位保管且可能涉及违法犯罪的情况，要及时收集相关证据，比如假证本身、用人单位保管假证的证据、使用假证的相关记录等，以便在后续处理中维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。