结论：作为房东，在租户仅微信转账1000元且未签订合同的情况下，能否退还该款项，主要取决于这1000元的性质以及双方是否有相关约定或沟通记录。以下从不同角度进行分析：
一、1000元性质的角度
若1000元为定金：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，定金是作为债权担保的一种方式，给付定金的一方不履行债务或者履行债务不符合约定，致使不能实现合同目的的，无权请求返还定金。
- 在此情况下，如果租户明确表示这1000元为定金，并且由于租户的原因不想继续租赁，那么您作为房东有权不退还这1000元。
若1000元为预付款或订金：
- 预付款或订金通常被视为合同履行的一种预先支付，不具有定金的担保性质。
- 如果双方没有明确约定这1000元的性质为定金，或者租户表示这1000元只是作为预付款或订金，那么在租户不想继续租赁的情况下，您应当退还这1000元。
二、双方约定或沟通记录的角度
有明确约定：
- 如果双方在微信聊天或其他沟通方式中明确约定了这1000元的性质、退还条件等，那么应当按照约定执行。
- 例如，如果双方约定这1000元为定金，并且约定了如果租户不想租赁则定金不退，那么您有权不退还。
无明确约定：
- 如果双方没有明确约定这1000元的性质或退还条件，那么根据公平原则和诚实信用原则，您应当退还这1000元，除非您能证明这1000元已经用于了与租赁相关的支出或损失。
三、实际操作建议
查看沟通记录：
- 首先，您应当仔细查看与租户的微信聊天记录或其他沟通方式，确认双方是否有关于这1000元的明确约定。
与租户协商：
- 如果双方没有明确约定或沟通记录存在歧义，建议您与租户进行协商，尝试达成一个双方都能接受的解决方案。
保留证据：
- 无论最终结果如何，您都应当保留好与租户的沟通记录、转账记录等证据，以备不时之需。
后续思考依据：在处理此类纠纷时，关键在于明确款项的性质以及双方是否有相关约定。如果双方无法达成一致，可能需要通过法律途径解决。因此，建议您在处理此类问题时保持谨慎，并尽可能保留好相关证据。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。