作为部门经理，在您公司有国企股份但不控股的情况下，是否会被纪委调查，这并非一个绝对的问题，而是取决于多种因素的综合考量。以下是我从不同角度为您进行的分析：

1. 纪委调查的对象与范围：

   • 纪委主要调查的是公职人员，特别是那些涉嫌违反党纪国法的行为。在国企或国有控股企业中，纪委的调查范围通常涵盖企业的管理层和关键岗位人员，以监督其是否履行职责、是否存在腐败行为等。
   • 如果您所在的公司虽然含有国企股份，但并非国企或国有控股企业，且您作为部门经理并非公职人员，那么从一般意义上讲，您不属于纪委的直接调查对象。然而，这并不意味着您完全不会受到纪委的关注，如果您的行为与国企股份相关联，且涉嫌违法违纪，仍有可能被纳入调查范围。

2. 公司性质与股权结构的影响：

   • 公司含有国企股份，但并不控股，这意味着公司的经营和管理可能更多地受到非国有股东的影响。在这种情况下，纪委的调查重点可能更多地放在国企股东派驻的管理人员或关键岗位人员上。
   • 但如果您作为部门经理，在公司的经营决策中扮演了重要角色，且您的行为可能影响到国企股东的利益，那么您也有可能成为纪委调查的对象，尤其是当您的行为涉嫌违法违纪时。

3. 个人行为与合规性：

   • 无论您所在公司的性质如何，作为部门经理，您都应当遵守法律法规和公司的规章制度。如果您的行为涉嫌违法违纪，如贪污受贿、滥用职权等，那么无论公司是否含有国企股份，您都有可能受到法律的制裁和纪委的调查。
   • 因此，保持个人行为的合规性，是避免被纪委调查的关键。

4. 实际案例与风险评估：

   • 在实际案例中，纪委的调查往往基于具体的线索和证据。如果您没有涉及任何违法违纪行为，且您的行为符合公司的规章制度和法律法规的要求，那么您被纪委调查的风险相对较低。
   • 但为了降低潜在风险，我建议您定期进行自我风险评估，确保自己的行为始终符合法律法规和公司的要求。

建议：

• 作为部门经理，您应当密切关注公司的经营状况和股权结构变化，了解自己的职责和权限范围。
• 保持个人行为的合规性，遵守法律法规和公司的规章制度，避免涉及任何违法违纪行为。
• 如果您对公司的某些决策或行为存在疑虑或担忧，建议及时与公司高层或法律顾问沟通，以确保自己的行为符合法律法规和公司的要求。

如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。作为专注于公司事务和股权转让领域的律师，我将竭诚为您提供专业的法律服务。