结论前置：在商铺拆迁时，若持有合法有效的营业执照，经营者有权索要相关赔偿，包括房屋价值补偿、搬迁与临时安置补偿、停产停业损失补偿、装饰装修补偿以及设备设施补偿等多个方面。
一、法律依据
根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条，市、县级人民政府在征收房屋时，必须给予被征收人包括房屋价值补偿、搬迁与临时安置补偿、停产停业损失补偿在内的多项补偿。这一规定为持有营业执照的商铺在拆迁时获得相应赔偿提供了明确的法律依据。
二、具体可索要的赔偿项目
房屋价值补偿：
- 商铺的房屋价值通常由专业的评估机构根据区位、用途、建筑面积等因素进行评估确定。持有营业执照的商铺，因其商业用途，可能获得更高的房屋价值评估结果。
搬迁与临时安置补偿：
- 搬迁补偿：涵盖设备拆卸、运输、安装费用及货物搬运、仓储费用。有营业执照的合法经营商铺必然会涉及这些费用，因此可以获得相应补偿。
- 临时安置补偿：用于支付拆迁后临时寻找新经营场所的租金、水电费等。这也是对商铺经营者因拆迁而遭受的额外经济负担的合理弥补。
停产停业损失补偿：
- 针对合法经营状态下的商铺，因拆迁导致的无法正常经营而产生的损失。补偿金额通常根据商铺被征收前的效益、停产停业期限等因素确定，具体计算方法因地制宜。营业执照是证明商铺正在合法经营并据此计算损失的关键证据。
装饰装修补偿：
- 对商铺内装饰装修部分，按评估价值给予补偿。如装饰装修由经营者自行出资，则补偿归经营者所有。这也是对商铺经营者在装修方面投入的一种合理回报。
设备设施补偿：
- 商铺内的空调、电梯、货架等设备设施，因拆迁需拆除、搬迁或重新购置的费用应得到补偿。这些设备设施是商铺正常运营所必需的，因此其损失也应得到合理弥补。
三、主张赔偿的注意事项
确保营业执照合法有效：
- 营业执照需处于有效期内，且注册地址与被拆迁商铺地址一致。如果营业执照存在不合法情况，如过期未年检、伪造营业执照等，商铺可能无法获得基于合法经营的相关补偿，甚至可能面临行政处罚。
收集保存经营证据：
- 及时收集和保存纳税记录、财务报表、租赁合同、进货凭证等与经营相关的证据。这些证据将作为计算各项补偿的依据，确保商铺经营者能够获得公正、合理的赔偿。
积极协商与法律途径：
- 首先尝试与拆迁方进行协商，明确赔偿标准和方式。在协商过程中，商铺经营者应充分表达自己的诉求和理由，争取达成公平合理的赔偿协议。
- 若协商不成，商铺经营者应及时通过法律途径维护自己的合法权益。这包括申请行政复议或提起行政诉讼等，确保自己的权益得到充分保障。
四、特殊情况下的赔偿问题
- 如果商铺实际使用性质与房屋产权登记用途不符且未经批准，补偿标准可能按原登记用途确定。因此，商铺经营者在经营过程中应确保合法合规，避免因此类问题而遭受不必要的损失。
五、其他影响赔偿的因素
- 地区政策差异：商铺拆迁赔偿的具体政策可能因地区而异。不同地区可能会有不同的拆迁补偿标准和规定，因此在具体案件中需参考当地的法律法规和政策文件。
- 拆迁原因：拆迁原因也可能影响赔偿标准。例如，因公共利益需要进行的拆迁与因商业开发需要进行的拆迁，在赔偿标准上可能存在差异。
综上所述，持有合法营业执照的商铺在面临拆迁时，应充分了解自身权益和可索要的赔偿项目，并积极采取措施确保自身合法权益得到有效保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。