当超市面临拆迁且您持有合法营业执照时，赔偿问题确实需要综合考虑多个方面，以确保您的合法权益得到充分保障。以下是对此问题的详细解答：

一、赔偿的主要方面

1. 房屋价值补偿：

   • 无论房屋是否用于商业经营，只要您拥有合法产权，拆迁方都应按照类似房地产的市场价格进行补偿。
   • 补偿金额通常由具有资质的房地产价格评估机构确定，他们会考虑房屋的区位、用途、建筑结构、新旧程度、建筑面积及占地面积等因素。

2. 停产停业损失补偿：

   • 由于拆迁导致超市无法正常经营，您有权获得停产停业损失的补偿。
   • 补偿条件通常包括：房屋合法产权、持有效营业执照且经营场所与被拆迁房屋一致、存在实际生产经营活动并产生经济效益。
   • 补偿范围可能涵盖利润损失、原材料和半成品损失、合同违约损失等。
   • 补偿标准可能因地区而异，有的按被征收房屋价值的一定比例（如5%-10%）计算，有的根据经营收入或利润指标确定，还有的按房屋面积计算。

3. 搬迁与安置费用补偿：

   • 搬迁费：根据搬迁物品的数量、重量、运输距离等因素，参考市场专业搬家公司收费情况确定。
   • 临时安置费：如果选择产权调换，拆迁方通常需要提供临时安置费，标准一般按被拆迁房屋面积和当地租房市场价格确定。

4. 设备搬迁与安装费用补偿：

   • 对于超市内的设备，如货架、冷藏设备等，拆迁方应补偿设备的拆卸、运输、安装及调试等费用。
   • 具体金额根据设备实际情况和市场价格确定，可以委托专业评估机构进行评估。

5. 装修附属物补偿：

   • 对超市内的装修及附属设施，如门窗、招牌、照明设备等，根据其实际价值进行评估补偿。
   • 补偿方式通常按重置成新价给予补偿，考虑装修和附属物的原始造价、使用年限及折旧程度等因素。

6. 员工安置补偿：

   • 如果因拆迁导致员工解雇或重新安置，您可能需要支付经济补偿或提供安置方案。
   • 这部分费用也可能纳入拆迁补偿范围，具体取决于当地政策和协商结果。

二、操作建议

1. 了解当地政策：详细查阅当地的拆迁补偿政策和标准，确保自己的权益得到充分保障。
2. 保留证据材料：在协商赔偿时，提供充分的证据和材料来支持自己的主张，如工商营业执照、税务登记证、财务报表、装修合同、设备发票等。
3. 咨询专业人士：如有需要，可咨询专业的律师或评估机构来帮助评估损失和制定赔偿方案。
4. 保持沟通协商：与拆迁方保持良好沟通，积极参与协商过程，争取获得合理的赔偿。若协商无果，可通过法律途径维护自己的合法权益。

三、注意事项

• 不同性质的拆迁（如政府主导的城市更新、商业开发等）可能会影响赔偿的标准和程序，因此了解拆迁性质和原因也很重要。
• 在协商过程中，坚持自己的合法权益，不要轻易接受不合理的赔偿方案。

综上所述，当超市面临拆迁且您持有合法营业执照时，赔偿应全面考虑房屋价值、停产停业损失、搬迁与安置费用、设备搬迁与安装费用、装修附属物补偿以及员工安置补偿等多个方面。希望这些信息能帮助您更好地了解自己的权益并争取到合理的赔偿。