非法经营烟草数额达到五万元以上会立案。不过，非法经营烟草罪的立案标准并不仅仅局限于非法经营数额，还包括违法所得数额、非法经营卷烟的数量以及特殊情形下的再犯情况。以下是对这些立案标准的详细解析：
非法经营数额：
- 非法经营烟草制品的数额达到五万元以上，这里的“非法经营数额”包括制造、储存、运输、销售烟草专卖品的全部价值，无论是否已销售。例如，若某烟贩私自批发销售香烟，累计销售金额或相关经营数额达到6万元，即满足立案条件。
违法所得数额：
- 通过非法经营烟草获得的利益达到二万元以上。违法所得是指行为人通过非法活动实际获利的金额。若某烟贩通过非法经营香烟获利2.5万元，同样符合立案标准。
非法经营卷烟数量：
- 非法经营的卷烟数量达到二十万支以上。这一数量标准以实际查获的数量为准，不论是否已销售。如执法部门查获某商家囤积的未销售卷烟共计22万支，即满足立案要求。
特殊立案情形：
- 若行为人曾因非法经营烟草制品在三年内受过二次以上行政处罚，之后再次非法经营且数额在三万元以上，即便未达到五万元的非法经营数额标准，也可能被立案追究刑事责任。例如，李某因非法经营烟草两次受到行政处罚后，再次从事此类活动且数额达到3.5万元，即属于此种特殊立案情形。
法律后果与量刑：
- 根据非法经营的数额大小，烟草非法经营罪可分为“情节严重”和“情节特别严重”两种情形，分别对应不同的量刑标准。
- 情节严重：非法经营数额在五万元以上，或违法所得数额在二万元以上，或非法经营卷烟二十万支以上，或曾因非法经营烟草专卖品三年内受过二次以上行政处罚又非法经营且数额在三万元以上。量刑为处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。
- 情节特别严重：非法经营数额在二十五万元以上，或违法所得数额在十万元以上，或非法经营卷烟一百万支以上。量刑为处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
建议：
- 鉴于非法经营烟草行为的严重性和法律责任，建议相关从业者严格遵守国家烟草专卖管理法律法规，确保合法经营。
- 若已涉嫌非法经营烟草，应及时向我咨询，以获取准确的法律意见和帮助，避免不必要的法律风险。
综上所述，非法经营烟草罪的立案标准是多方面的，不仅涉及非法经营数额，还包括违法所得数额、非法经营卷烟的数量以及特殊情形下的再犯情况。对于此类违法行为，法律将给予严厉的制裁。因此，建议广大市民和经营者自觉遵守法律法规，共同维护良好的市场秩序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。