当夫妻协议被认定为无效时，处理方式主要取决于协议无效的具体原因以及协议的内容类型（如财产协议、婚姻效力协议等）。以下我将结合您提供的信息，详细阐述夫妻协议无效时的处理流程和注意事项。
一、确认协议无效的原因
首先，需要明确协议无效的具体原因，这通常包括：
违反法律法规：协议内容若违反法律、行政法规的强制性规定，如限制人身自由、剥夺基本权利等，则协议无效。例如，协议中约定“一方不得提出离婚”或“离婚后一方不得再婚”等条款，因违反婚姻自由原则而无效。
欺诈、胁迫：若一方以欺诈、胁迫手段使对方在违背真实意思的情况下订立协议，受损害方有权请求撤销该协议。
显失公平：协议内容明显不公平，导致双方权利义务严重失衡，受损害方可以主张撤销协议。
恶意串通，损害他人合法权益：夫妻双方恶意串通，通过协议损害国家、集体或第三人的利益，该协议无效。
形式要件缺失：对于某些特定类型的协议，如财产协议，若未采用书面形式，可能不被法院认可。
二、根据协议类型采取相应处理措施
1. 财产协议无效
若涉及的是婚后财产协议无效，处理措施包括：
协商解决：双方应首先尝试通过友好协商解决争议，重新签订合法有效的财产协议。在协商过程中，可以寻求专业律师的帮助，确保新协议的合法性和有效性。
诉讼解决：如果协商不成，任何一方可以向人民法院提起诉讼，请求确认协议无效或撤销协议。法院将依法审查协议的内容和签订过程，判断其是否有效。
财产分割：协议被确认无效后，应按照法定财产制进行财产分割。根据《民法典》的相关规定，夫妻共同财产原则上应均等分割，同时考虑照顾子女、女方和无过错方的权益。
赔偿损失：如果因协议无效给对方造成损失的，有过错的一方应承担赔偿责任。赔偿范围包括直接损失和间接损失，具体数额由法院根据实际情况确定。
2. 婚姻效力协议无效（即婚姻无效）
若涉及的是婚姻效力问题，如婚姻被认定为无效，处理措施则包括：
确认婚姻无效：根据《民法典》，有权向人民法院申请宣告婚姻无效的主体包括婚姻当事人及利害关系人。法院将按照特别程序进行一审终审，不适用调解。若经审理确认存在婚姻无效的法定情形（如重婚、有禁止结婚的亲属关系、未到法定婚龄），法院将判决婚姻无效。
财产处理：同居期间所得的财产，首先由当事人协议处理；协议不成时，人民法院将根据照顾无过错方的原则进行判决。对于共同购置且用于共同生活的财产，按共有财产分割原则处理；个人所有的财产归个人所有。
子女抚养：无效婚姻所生子女享有与婚生子女同等的权利。父母双方应就子女的抚养问题达成协议；协议不成时，由法院根据最有利于未成年子女的原则判决。不直接抚养子女的一方应负担抚养费。
三、注意事项
保留证据：在处理协议无效问题时，双方应妥善保留与协议相关的证据材料，如协议文本、沟通记录、转账凭证等。这些证据将有助于法院查明事实真相，作出公正裁决。
及时维权：一旦发现协议存在问题或可能无效的情况，应及时采取措施维护自己的合法权益。不要拖延时间，以免错过最佳维权时机。
遵守法律程序：在处理协议无效问题时，应严格遵守法律程序和相关规定。不要采取过激行为或非法手段来解决问题，否则可能承担法律责任。
寻求专业帮助：由于协议无效问题可能涉及复杂的法律关系和财产分割问题，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议与帮助。
综上所述，夫妻协议无效时的处理方式取决于协议无效的具体原因和协议类型。在处理过程中，应遵循法律规定和程序要求，确保各方合法权益得到充分保护。