在职务犯罪案件中，自首情节的认定主要由司法机关（包括公安机关、人民检察院和人民法院）根据犯罪嫌疑人的投案行为和供述情况来综合判断。以下是对这一问题的详细解答：
一、自首的构成要件
自首的认定主要依据《中华人民共和国刑法》第六十七条的规定，需要满足两个核心要件：
自动投案：
- 犯罪事实或犯罪嫌疑人未被司法机关发觉，或虽被发觉但尚未受到讯问、未被采取强制措施时，主动向公安机关、人民检察院或人民法院投案。
- 投案方式多样，包括直接向司法机关投案、向所在单位或城乡基层组织投案、委托他人代为投案或以信电方式投案等。
- 特殊情况下，如因形迹可疑被盘问后主动交代罪行、犯罪后逃跑过程中主动投案、正准备投案时被捕获，以及经亲友规劝、陪同投案或公安机关通知后投案等，也视为自动投案。
如实供述自己的罪行：
- 犯罪嫌疑人必须如实交代自己的主要犯罪事实。若犯有数罪，仅如实供述部分犯罪的，只对如实供述部分认定为自首。
- 在共同犯罪中，犯罪嫌疑人除如实供述自己的罪行外，还需供述所知的同案犯，主犯则需供述所知其他同案犯的共同犯罪事实，方能认定为自首。
二、自首情节的认定部门
在职务犯罪案件中，自首情节的认定主要由以下部门负责：
公安机关：
- 公安机关是刑事案件的侦查机关，负责初步调查和收集证据。在职务犯罪案件中，如果犯罪嫌疑人主动向公安机关投案并如实供述自己的罪行，公安机关会进行初步认定，并将相关材料移送至人民检察院。
人民检察院：
- 人民检察院是职务犯罪案件的审查起诉机关，负责对公安机关移送的案件进行审查，并决定是否提起公诉。在审查过程中，人民检察院会进一步核实犯罪嫌疑人的自首情节，并根据法律规定和案件事实作出认定。
人民法院：
- 人民法院是刑事案件的审判机关，负责最终审理和判决。在职务犯罪案件的审判过程中，人民法院会全面审查案件事实和证据，包括犯罪嫌疑人的自首情节，并根据法律规定作出最终判决。
三、特殊情形下的自首认定
在职务犯罪案件中，还存在一些特殊情形下的自首认定问题，如单位自首、特别自首（准自首）等。这些情形的认定需要综合考虑多种因素，并遵循相关法律规定和司法解释。
单位自首：
- 单位犯罪案件中，单位集体决定或者单位负责人决定而自动投案，如实交代单位犯罪事实的，应当认定为单位自首。
- 单位直接负责的主管人员自动投案，如实交代单位犯罪事实的，也应视为单位自首。但需注意，如果仅由单位内部的一般工作人员投案并交代罪行，而单位本身未主动投案，则不能认定为单位自首。
特别自首（准自首）：
- 被采取强制措施的犯罪嫌疑人、被告人和已宣判的罪犯，如实供述司法机关尚未掌握的与已掌握或判决确定的罪行属不同种罪行的，以自首论。若如实供述的同种罪行较重，一般应当从轻处罚。
四、法律后果与司法实践
对于自首的犯罪分子，根据《刑法》的规定，可以从轻或者减轻处罚；其中，犯罪较轻的，可以免除处罚。这一规定体现了法律对自首行为的鼓励和对悔罪态度的认可。在司法实践中，认定自首时需严格审查犯罪嫌疑人的主观认罪、悔罪态度，客观投案的主动性和自愿性，以及供述时的诚恳态度和配合程度。
总结来说，职务犯罪案件中自首情节的认定主要由司法机关（公安机关、人民检察院和人民法院）根据犯罪嫌疑人的投案行为和供述情况来综合判断。在认定过程中，需严格遵循法律规定和司法解释，确保自首情节的认定既符合法律要求，又能体现司法公正和效率。如果您或您身边的人涉及职务犯罪案件，并希望了解自首情节的认定问题，请随时向我咨询。