结论：配偶的儿子协议归属其前夫抚养后，是否还是继子关系，这主要取决于您与该孩子之间是否形成了法律上的继父母与继子女关系，以及这种关系是否因抚养协议的变更而受到影响。以下从不同角度进行分析：

1. 继父母与继子女关系的形成：

   • 继父母与继子女关系通常是由于父母一方再婚而形成的。在您与配偶结婚时，如果配偶带有子女，那么您与该子女之间就自然形成了继父母与继子女的关系。
   • 这种关系一旦形成，就具有一定的法律效应，包括相互之间的抚养、赡养等义务（在符合法定条件的情况下）。

2. 抚养协议变更的影响：

   • 如果配偶的儿子原本由您和配偶共同抚养，但后来通过协议方式变更为由其前夫抚养，这并不意味着继父母与继子女的关系自动终止。
   • 继父母与继子女关系的终止通常需要满足一定的法律条件，如继父母与继子女之间明确表示不再愿意维持这种关系，或者通过法律程序进行解除。
   • 仅仅因为抚养协议的变更，并不足以直接导致继父母与继子女关系的终止。除非在协议中明确约定了关系的终止，或者双方通过其他方式明确表达了终止关系的意愿。

3. 实际抚养情况对关系的影响：

   • 即使抚养协议变更，如果您与该孩子之间仍然保持着实际的抚养、教育等关系，那么从实际角度来看，您与该孩子之间的继父母与继子女关系可能仍然存在。
   • 法律在认定继父母与继子女关系时，除了考虑形式上的关系外，还会考虑实际的生活、抚养情况。

4. 法律建议：

   • 如果您希望明确与该孩子之间的法律关系，或者担心未来可能出现的法律纠纷，建议您咨询专业律师，通过法律途径进行明确。
   • 您可以与配偶及其前夫协商，就孩子的抚养、教育以及您与孩子之间的关系等问题达成明确的协议，并可以考虑进行公证或法律确认，以保障各方的权益。

总结与进一步思考： 继父母与继子女关系是一个复杂的法律问题，涉及到多个方面的因素。在抚养协议变更的情况下，是否还是继子关系并不能一概而论，而需要根据具体情况进行判断。如果您对此有进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律服务。