房屋征收补偿安置协议书女方由男方代签的，其效力需根据具体情况判断，一般而言，若未经女方授权或事后追认，则该协议对女方不发生法律效力。以下从不同角度进行分析：
一、代理权限的角度
有授权的代理：
- 如果女方事先明确授权男方代为签署房屋征收补偿安置协议书，或者事后对该代理行为进行了追认，那么男方的代签行为是有效的，该协议对女方具有法律约束力。
无授权的代理：
- 如果男方未经女方授权，擅自代为签署协议，且事后女方也未对该行为进行追认，那么男方的代签行为构成无权代理。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无权代理行为未经被代理人追认的，对被代理人不发生效力。因此，在这种情况下，该协议对女方不具有法律约束力。
二、表见代理的特殊情况
- 尽管男方未经女方授权代签协议，但如果女方在客观上存在使相对人（如征收部门）相信男方有代理权的理由，且相对人主观上为善意且无过失，那么可能构成表见代理。在表见代理的情况下，为了保护相对人的合法权益，法律会认定该代理行为有效，即该协议对女方具有法律约束力。然而，表见代理的认定需要严格的条件，且在实践中较为少见。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 如果协议被认定无效或对女方不发生法律效力，那么女方有权拒绝履行协议中的义务，并可能要求征收部门重新与其协商补偿安置事宜。同时，如果男方因代签行为给女方造成损失的，女方还有权要求男方承担赔偿责任。
建议：
- 在涉及房屋征收补偿安置等重大事项时，建议当事人亲自签署相关协议，以确保自身权益得到保障。
- 如果确实需要他人代为签署协议，应事先出具明确的授权委托书，并明确代理权限和期限等事项。
- 在签署协议前，应仔细阅读协议内容，确保了解并同意其中的各项条款。如有疑问或不确定之处，应及时咨询专业律师或相关部门。
总结来说，房屋征收补偿安置协议书女方由男方代签的效力取决于男方是否具有代理权限以及是否构成表见代理。在涉及此类问题时，建议当事人谨慎处理并咨询专业律师的意见。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。