要驳回或推翻已签字的协议并使其被认定无效，这确实是一个涉及法律层面的复杂问题。首先，必须明确的是，要推翻协议的有效性，必须证明该协议符合合同无效的法定情形，并且需要通过合法的途径，如诉讼或仲裁，来提出这一主张，同时提供充分的证据来支持。
接下来，我将详细阐述合同无效的几种法定情形，这些情形是推翻协议有效性的关键依据：
无民事行为能力人签订的协议无效：
- 如果协议是由不满八周岁的未成年人或不能辨认自己行为的成年人签订的，那么这份协议是无效的。因为这类人群缺乏足够的判断力和行为能力，无法对自己的行为负责。
虚假意思表示签订的协议无效：
- 如果双方是以虚假的意思表示签订的协议，比如为了逃避债务而虚假签订买卖合同，实际上并没有真实的交易意图，那么这份协议也是无效的。
违反法律法规强制性规定的协议无效：
- 协议的内容如果违反了法律、行政法规的强制性规定，比如未取得建设工程规划许可证而签订的建设工程施工合同，那么这份协议同样无效。
违背公序良俗的协议无效：
- 协议的内容如果违背了社会公共秩序和善良风俗，比如签订以人身伤害为内容的打赌协议，那么这份协议也是无效的。
恶意串通损害他人合法权益的协议无效：
- 如果行为人与相对人恶意串通，损害了第三方的合法权益，比如债务人与第三人恶意串通低价转让财产，那么这份协议也是无效的。
签署时存在欺诈、胁迫等情形的协议可撤销：
- 这一点需要特别注意，它导致的是协议可撤销，而非直接无效。如果一方使用欺诈、胁迫手段使对方在违背真实意愿的情况下签署了协议，那么受欺诈或胁迫的一方可以主张撤销这份协议。
协议主体不适格或形式不符合法律规定：
- 比如未经授权的代理人签署的协议，或者协议的形式不符合特定要求（如需书面形式、公证等），这些也可能影响协议的效力。
在明确了合同无效的法定情形后，接下来是推翻协议书无效的操作步骤：
收集证据：
- 这是至关重要的一步。需要收集所有能证明协议存在上述无效情形的证据，包括书面材料、电子邮件、聊天记录、证人证言以及相关的法律法规条文等。
咨询专业律师：
- 在收集了足够的证据后，建议寻求专业律师的帮助。律师可以评估案件情况，提供专业的法律意见和指导，帮助制定合适的策略。
尝试协商解决：
- 在提起诉讼或申请仲裁之前，可以尝试与对方协商解决。说明协议存在的无效情形，要求解除或确认协议无效。如果对方认可，可以签订解除协议的文件，从而避免法律纠纷。
提起诉讼或申请仲裁：
- 如果协商不成，那么就需要向有管辖权的人民法院提起诉讼，或者根据协议中的仲裁条款向仲裁机构申请仲裁，请求确认协议无效。
遵循法律程序：
- 在整个过程中，务必遵循法律程序和要求。提交必要的文件，出庭应诉等，确保自己的权益得到充分保障。
综上所述，要推翻已签字的协议并使其被认定无效，需要明确协议无效的法定情形，收集充分的证据，通过合法的途径提出主张，并严格遵循法律程序。同时，寻求专业律师的帮助将大大提高成功的几率。希望这些信息能对您有所帮助。