结论：中介合同三份中只有中介那份留存且盖了公章，并不直接决定合同的生效与否。合同的生效需依据合同法的相关规定，结合合同的具体内容、双方当事人的意思表示以及是否满足法律规定的生效条件等因素来综合判断。
分析说明：
合同生效的基本条件：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同生效一般需要满足以下条件：行为人具有相应的民事行为能力；意思表示真实；不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
- 在中介合同中，这些条件同样适用。即中介和委托人（或双方）需具备签订合同的民事行为能力，合同内容需是双方真实意思的表示，且不违反法律法规的强制性规定。
公章的作用：
- 公章是合同生效的一种形式要件，它代表了公司或组织的正式认可和授权。然而，公章的存在并不是合同生效的唯一或决定性因素。
- 如果合同内容本身存在违法或违背公序良俗的情况，即使盖有公章，合同也可能被认定为无效。
- 另一方面，如果合同内容合法且双方意思表示真实，即使只有一份合同盖有公章（且该份合同为双方所认可），也不影响合同的生效。但通常为了保障双方权益，合同会一式多份，每份都应由双方签字或盖章确认。
合同份数与生效的关系：
- 合同的份数并不直接影响合同的生效。合同的生效主要取决于合同内容是否合法、双方意思表示是否真实以及是否满足法律规定的生效条件。
- 然而，从实务操作的角度来看，多份合同的存在可以方便双方保存和查阅，也有助于在发生争议时提供证据。如果只有一份合同且由中介留存，可能会给委托人带来不便，并在一定程度上增加争议的风险。
特殊场景：
- 如果中介合同中明确约定了“本合同自双方签字或盖章之日起生效，且需一式多份，每份均具有同等法律效力”，那么只有一份合同盖有公章且由中介留存的情况，可能不符合合同的约定，从而影响合同的生效或执行。但这种情况下的影响也需结合具体合同内容和双方当事人的意思表示来综合判断。
后续行动建议：
- 审查合同内容：首先审查中介合同的具体内容，确认是否满足合同生效的基本条件。
- 与中介沟通：与中介进行沟通，了解合同签订的具体情况，包括公章的加盖过程、合同份数的分配等。
- 寻求法律帮助：如果对合同的生效存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况提供针对性的法律建议。
法律依据：
- 《中华人民共和国民法典》第一百四十三条：具备下列条件的民事法律行为有效：（一）行为人具有相应的民事行为能力；（二）意思表示真实；（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
- 《中华人民共和国民法典》第四百九十条：当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。