针对您提出的“在农村死者尸体无故长时间存放怎么处理”的问题，这确实是一个需要细致且合规处理的情况。虽然您提供的参考信息主要基于《东莞市无人认领遗体处理办法(修订)》，但其中的一些原则和流程具有普遍适用性，我可以结合这些信息以及一般性的处理流程来为您解答。

一、初步确认与报告

1. 确认遗体状态：首先，需要确认遗体是否确实处于无人认领或长时间存放的状态，以及是否存在特殊情况（如涉及刑事案件、医疗纠纷等）。

2. 报告相关部门：一旦确认，应立即向当地公安机关报告，同时通知村委会或相关社区组织。公安机关将负责调查遗体的身份和死因，这是处理此类情况的第一步。

二、调查与取证

1. 公安机关调查：公安机关会展开调查，包括询问目击者、检查现场、调取监控等，以确定遗体的身份和死因。

2. 收集证据：在调查过程中，会收集与遗体相关的所有证据，包括身份证明、死亡证明（如果可能的话）、现场照片等。

三、遗体存放与管理

1. 存放场所：在调查期间，遗体通常会被存放在当地的殡仪馆或指定的遗体存放场所。如果农村地区没有殡仪馆，可能会存放在医疗卫生机构的暂存区或其他合适的地方。

2. 存放时间：遗体的存放时间会根据调查进展和当地法规来确定。一般来说，如果长时间无人认领，且调查无果，相关部门会按照法规进行处理。

3. 延期要求：如果因特殊原因需要延长存放时间，应向相关部门提出申请，并说明理由。

四、处理流程

1. 正常死亡且无人认领：如果遗体被确认为正常死亡且无人认领，相关部门会按照当地法规进行公告，公告期满后仍无人认领的，将按照无人认领遗体处理流程进行火化或安葬。

2. 非正常死亡或涉及特殊情况：如果遗体涉及刑事案件、交通事故、医疗纠纷等特殊情况，将按照相关法律法规和程序进行处理。这可能需要更长时间的调查和取证工作。

3. 涉外、涉台港澳侨等特殊情况：如果遗体涉及外国人、台港澳侨等特殊情况，将按照相关外事政策和法规进行处理。

五、经费与结算

1. 经费来源：无人认领遗体的处理经费通常由当地财政承担，具体分担方式可能因地区而异。在农村地区，可能会由县级或乡镇级财政承担。

2. 结算办法：处理完毕后，相关部门会按照规定的结算办法进行经费结算和报销。

六、后续事宜

1. 骨灰处理：火化后的骨灰将按照当地法规进行处理，可能是安葬在公墓、骨灰堂或进行海葬、树葬等生态葬方式。

2. 资料留存：所有与遗体处理相关的资料和记录都将被妥善留存，以备后续查询和审计。

七、建议与注意事项

1. 加强宣传与教育：建议当地政府和社区组织加强殡葬法规的宣传和教育，提高公众对无人认领遗体处理流程的认识和理解。

2. 完善处理机制：针对农村地区可能存在的特殊情况，建议完善无人认领遗体处理机制，确保处理流程合规、高效且人性化。

3. 尊重逝者与家属：在整个处理过程中，应始终尊重逝者和家属的权益和感受，确保处理工作得到家属的理解和支持。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。