如果对方不配合做亲子鉴定，这确实是一个比较棘手的问题，但我们可以根据不同的法律场景和实际情况，采取一些合法且有效的策略来应对。以下是一些详细的建议：
一、尝试深入沟通与协商
解释亲子鉴定的目的和重要性：
- 你可以向对方详细解释亲子鉴定在确认亲子关系、解决抚养权、继承权等问题上的关键作用。
- 强调亲子鉴定结果对双方及孩子的长远利益，以及它在法律上的权威性。
借助第三方调解：
- 如果直接沟通无果，可以邀请双方都信任的亲朋好友、社区工作人员或专业调解机构介入。
- 他们可能能从更中立的角度出发，帮助化解矛盾，促使对方同意进行亲子鉴定。
二、寻求法律途径
（一）民事诉讼中申请亲子鉴定
收集相关证据：
- 在提起诉讼前，尽可能收集能证明亲子关系存在或不存在的证据，如出生证明、生活照片、证人证言、分居证明等。
- 这些证据将有助于支持你的主张，并在对方拒绝鉴定时，为法院作出不利推定提供依据。
向法院提起诉讼：
- 如果亲子关系问题涉及到抚养纠纷、财产分割等民事案件，你可以向有管辖权的人民法院提交起诉状和相关证据材料。
- 在诉讼过程中，明确向法院提出亲子鉴定的申请，并说明理由和依据。
法院的处理方式：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第三十九条规定，如果对方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，法院可以认定你方的主张成立。
- 法院将结合其他证据和事实情况，依法作出对拒绝方不利的推定。
（二）刑事报案（涉嫌违法犯罪时）
判断是否涉嫌违法犯罪：
- 如果对方拒绝配合亲子鉴定的行为涉嫌违法犯罪，如拐卖儿童、遗弃罪等，你可以考虑向公安机关报案。
收集与案件有关的线索和证据：
- 在报案前，尽可能收集与案件有关的线索和证据，如嫌疑人的身份信息、作案时间、地点等。
向公安机关报案并配合调查：
- 及时向当地公安机关报案，如实陈述案件事实和提供相关证据。
- 配合公安机关的调查工作，按照公安机关的要求进行亲子鉴定等操作。
三、其他应对策略
寻求法律援助：
- 如果你对法律程序不熟悉或感到困惑，可以咨询专业律师，了解相关法律规定和程序。
- 律师可以为你提供法律建议，帮助你制定合适的策略，并在必要时代表你进行法律诉讼。
收集其他替代证据：
- 在无法进行亲子鉴定的情况下，积极寻找并收集其他类型的证据，如医疗记录、证人证言等。
- 这些证据可能在一定程度上替代亲子鉴定的作用，并由法院或其他相关机构评估其效力和可信度。
考虑调解、仲裁或诉讼等争议解决方式：
- 如果所有方法均无法解决问题，你可以考虑通过调解、仲裁或诉讼等方式来维护自身权益。
- 在这些过程中，专业律师的法律建议和帮助将至关重要。
综上所述，处理对方不配合做亲子鉴定的问题时，应综合考虑不同法律场景下的应对策略与法律规定。同时，灵活运用沟通、法律援助、收集证据及法律途径解决争议等方法，以有效维护自身合法权益。希望这些建议能对你有所帮助。