在农村宅基地上自建集装箱是否合法，需根据具体情况来判断，以下分合法与违法两种情况进行分析：
合法情况
临时性使用且获同意：
- 若在自家宅基地上进行短期活动，如房屋翻修时，临时放置集装箱用于存放工具、材料，且事先取得了村委会的同意，这种用途具有临时性和合理性，通常不被认定为违法。它未对宅基地的规划和正常使用造成实质性不良影响。
作为合法建筑附属：
- 如果集装箱经过合法审批手续，改造成符合居住、生产经营等合法用途的建筑，并与宅基地上的原有建筑共同构成一个完整的空间，那么这种放置行为是合法的。例如，将集装箱改造成特色民宿，并经过了相关部门的规划许可和审批。
符合规划与政策：
- 集装箱的放置需符合当地的城乡规划要求，不得影响市容市貌、妨碍交通等。若当地政策或规定允许集装箱作为临时建筑使用，且不占用土地指标，那么其合法性可能受到当地临时建筑管理规定的影响，需按规定办理相关手续。
违法情况
未经审批改变土地用途：
- 宅基地有其特定的用途和规划要求，若放置集装箱用于非宅基地规划用途，如未经批准的商业仓库，则违反了土地管理相关法律法规。任何改变土地用途的行为都需经过法定审批程序。
影响规划实施：
- 当集装箱的放置影响到农村整体规划的实施，破坏规划的整体性和协调性时，属于违法行为。例如，在新农村建设规划中，集装箱的放置不符合村庄规划设计要求。
存在安全隐患：
- 若集装箱的放置存在明显的安全隐患，如放置在消防通道上或结构不稳定，可能对周边人员和房屋造成安全威胁，这种情况下也是违法的。
违章建筑上的放置：
- 若宅基地本身属于违章建筑，那么在其上放置集装箱房同样属于违法行为。
改变使用性质：
- 集装箱房屋最初的设计意图主要是作为暂时性的居住场所，若将其改作他用，如工程施工、出租或餐饮等商业用途，可能违反相关规定。
建议与结论
为确保在农村宅基地上自建集装箱的合法性，我建议你：
- 咨询当地相关部门：了解具体的政策和规定，确保你的行为符合当地要求。
- 办理必要审批手续：如果集装箱的放置需要审批，务必按照流程办理相关手续。
- 确保安全合规：确保集装箱的放置不会对宅基地的规划和使用造成不良影响，同时消除安全隐患。
综上所述，农村宅基地上自建集装箱的合法性需综合考虑多个因素，包括当地政策、宅基地的土地用途、是否符合城乡规划以及是否经过相关审批等。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。