两个公司的法人可以互为对方公司办理网银业务，但从安全性和合规性角度存在多重风险，不建议直接操作。具体分析如下：

一、法律与合规层面

1. 职务代理权限问题
   根据《民法典》第61条，法定代表人以公司名义从事的民事活动，法律后果由公司承受。若法人代表公司办理网银业务（如开户、授权操作等），需确保其已获得公司章程或股东会/董事会的明确授权。若法人同时担任两家公司职务，需分别取得两家公司的合法授权，否则可能构成越权代理，导致操作无效或引发内部纠纷。

2. 银行账户管理规定
   根据《人民币银行结算账户管理办法》，企业开立银行账户需提供法定代表人身份证明、公司章程等材料。若法人代为办理另一家公司的网银业务，银行可能要求提供授权委托书及双方公司关系证明（如股权关系）。若两家公司无关联关系，银行可能拒绝办理或要求补充材料，操作难度较大。

二、安全风险层面

1. 资金安全风险
   网银业务涉及公司资金划转、支付密码等核心信息。若法人同时掌握两家公司的网银操作权限，可能因个人失误（如混淆账户）或主观故意（如挪用资金）导致资金损失。例如，法人误将A公司资金转入B公司账户，或利用B公司网银为A公司垫付货款，均可能引发法律纠纷。

2. 信息泄露风险
   网银操作需提供公司营业执照、公章、财务章等敏感信息。若法人代为办理另一家公司的网银业务，可能因信息保管不当（如丢失U盾、泄露密码）导致公司商业秘密泄露，甚至被不法分子利用进行诈骗或非法交易。

三、操作建议

1. 明确授权与分工
   若两家公司确需法人代为办理网银业务，应通过书面授权委托书明确权限范围（如仅限开户、不限资金划转），并由公司盖章确认。同时，建议指定专人负责网银操作，避免法人直接介入具体业务。

2. 加强内部管控
   公司应建立网银操作审批流程，例如：单笔资金划转需经财务负责人、法定代表人双签；定期核对银行流水，确保资金流向清晰。此外，可考虑使用“双U盾”制度（操作员U盾+授权员U盾），降低单人操作风险。

3. 法律文件备案
   若法人代为办理网银业务涉及重大事项（如开通大额支付权限），建议将授权委托书、公司决议等文件留存银行备案，以便后续核查。

总结：从法律合规和安全风险角度，不建议法人直接互为对方公司办理网银业务。若确有需要，应通过明确授权、加强管控、备案文件等方式降低风险。如有具体操作疑问，可进一步向我咨询。