公司能否追回担保款需视具体情况而定，主要取决于担保合同效力、主债务履行情况及追偿程序合法性。以下从不同角度展开分析：

1. 担保合同有效且主债务未履行
   若担保合同符合《民法典》第388条规定的要件（主体适格、意思表示真实、内容合法），且主债务人未按约定履行债务，公司作为担保人承担清偿责任后，可依据《民法典》第700条向主债务人追偿。追偿范围包括实际代偿金额、利息损失（按LPR计算）及实现债权费用（如诉讼费、律师费）。
   示例：A公司为B公司向银行贷款提供连带责任保证，B公司逾期未还，A公司代偿1000万元后，可起诉B公司要求偿还1000万元及资金占用利息。

2. 担保合同存在效力瑕疵

   • 主合同无效导致担保无效：根据《民法典》第388条，担保合同是主债权债务合同的从合同。若主合同因违反法律强制性规定（如贷款用途违法）被认定无效，担保合同亦无效。此时公司是否承担赔偿责任需区分过错：

     • 若公司无过错（如未参与主合同违法行为），不承担赔偿责任；
       
     • 若公司有过错（如明知主合同违法仍提供担保），需根据过错程度承担不超过债务人不能清偿部分1/3的赔偿责任（《民法典担保制度解释》第17条）。
       示例：C公司为D公司非法集资提供担保，集资行为被认定犯罪，主合同无效导致担保无效。若C公司明知集资违法仍提供担保，需对D公司不能清偿部分承担20%赔偿责任。

   • 担保合同自身无效：若担保合同因违反《民法典》第399条（如学校、幼儿园等公益机构以教育设施抵押）或未办理法定登记手续（如不动产抵押未登记）被认定无效，公司可能因过错承担赔偿责任，但无权追偿担保款本金。

3. 担保人已履行清偿义务后的程序要求
   公司行使追偿权需满足以下程序要件：

   • 实际代偿证明：需提供银行转账记录、代偿协议等证据证明已实际履行担保责任；
     
   • 时效限制：追偿权诉讼时效为3年，自公司向债权人清偿之日起计算（《民法典》第188条）；
     
   • 债务人抗辩权：若主债务人能证明公司代偿时存在重大过错（如未及时通知债务人导致其丧失抗辩权），可能部分或全部免除债务。

4. 特殊情形下的追偿限制

   • 混合担保中的追偿：若同一债务存在多个担保人（如既有保证又有抵押），公司承担担保责任后，仅能向债务人追偿，不得直接要求其他担保人分摊（《民法典》第392条）。但其他担保人承诺相互追偿的除外。
     
   • 企业破产程序中的追偿：若债务人进入破产程序，公司需及时申报债权，并在破产财产分配中按普通债权比例受偿，不得单独优先追偿。

行动建议：

1. 立即收集担保合同、代偿凭证、主债务合同等证据材料；
   
2. 核查主合同及担保合同效力，评估是否存在无效情形；
   
3. 若主债务人具备清偿能力，优先通过协商或诉讼追偿；
   
4. 若涉及混合担保或破产程序，需制定专项追偿策略。
   

如有进一步细节（如担保类型、主债务性质等），可提供具体信息以便深入分析。