结论：在原告提交转账记录起诉，而被告抗辩账户被公司借用且已打借条但未举证的情况下，法院通常会根据现有证据和法律规定进行综合判断，倾向于支持原告的诉求，但具体结果还需结合案件细节和证据情况。以下是对此问题的详细分析：

1. 证据规则与举证责任：

   • 在民事诉讼中，证据是认定事实的基础。根据“谁主张，谁举证”的原则，原告需要证明其与被告之间存在借贷关系，而转账记录是证明资金流动的重要证据。
   • 被告若抗辩称账户被公司借用且已打借条，则需承担相应的举证责任，即提供证据证明其抗辩事实的真实性。若被告未能提供充分证据，则其抗辩可能不被法院采纳。

2. 转账记录的法律效力：

   • 转账记录作为银行出具的官方凭证，具有较高的证明力。它能够直接证明资金从原告账户流向被告账户的事实。
   • 在没有相反证据的情况下，转账记录通常被视为借贷关系成立的有力证据。

3. 被告抗辩的审查：

   • 被告抗辩账户被公司借用且已打借条，这涉及到两个关键点：一是账户是否被借用，二是是否已打借条。
   • 对于账户是否被借用，被告需要提供证据证明公司实际使用了该账户进行资金往来，且原告在转账时知晓或应知这一情况。
   • 对于是否已打借条，被告需要提供借条原件或复印件等直接证据，以及可能的其他辅助证据（如证人证言、聊天记录等）来证明借条的存在和内容。

4. 法院的综合判断：

   • 法院在审理此类案件时，会综合考虑双方提供的证据、陈述以及案件的具体情况。
   • 若被告未能提供充分证据支持其抗辩，而原告提供的转账记录等证据又较为确凿，则法院可能会倾向于支持原告的诉求，认定借贷关系成立。
   • 当然，如果被告能在后续程序中提供充分证据证明其抗辩事实，法院也会根据新证据重新进行判断。

5. 可能的法律后果：

   • 若法院认定借贷关系成立，被告可能需要承担还款责任，包括返还本金和支付利息（如有约定）。
   • 若被告未能按时履行还款义务，原告还可以申请法院强制执行，对被告的财产进行查封、扣押或拍卖等措施。

建议：

• 对于原告而言，应妥善保管好转账记录等证据，并在诉讼中积极提供其他辅助证据（如聊天记录、证人证言等）来证明借贷关系的成立。
• 对于被告而言，若确实存在账户被借用且已打借条的情况，应尽快收集并整理相关证据，以便在诉讼中进行有效抗辩。
• 双方都应积极配合法院的审理工作，如实陈述事实、提供证据，以便法院能够公正、高效地处理案件。

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