结论：亲戚声称已将借款还给您儿子是否合法，需根据具体情况判断，包括借款的性质、还款的时间和方式、您儿子是否具备接受还款的资格等。以下从不同角度为您详细分析：
一、借款性质与还款对象
借款为夫妻共同债务：
- 若该借款是您妻子在婚姻关系存续期间以个人名义为家庭日常生活需要所负的债务，那么这笔借款通常会被认定为夫妻共同债务。在您妻子去世后，您作为配偶，有权要求亲戚继续履行还款义务，还款对象应是您或您与妻子的共同继承人（如子女、父母等，具体根据继承法规定确定），而非仅限于您儿子。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一千零六十四条，夫妻双方共同签名或者夫妻一方事后追认等共同意思表示所负的债务，以及夫妻一方在婚姻关系存续期间以个人名义为家庭日常生活需要所负的债务，属于夫妻共同债务。
借款为妻子个人债务：
- 若该借款是您妻子以个人名义超出家庭日常生活需要所负的债务，且未用于夫妻共同生活、共同生产经营或者基于夫妻双方共同意思表示，那么这笔借款通常会被认定为妻子的个人债务。在您妻子去世后，其遗产应首先用于清偿个人债务，清偿后的剩余部分再由继承人继承。若亲戚声称已将借款还给您儿子，需证明该还款行为得到了您妻子的授权或事后追认，或者您儿子作为继承人接受了该还款。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一千一百六十一条，继承人以所得遗产实际价值为限清偿被继承人依法应当缴纳的税款和债务。超过遗产实际价值部分，继承人自愿偿还的不在此限。继承人放弃继承的，对被继承人依法应当缴纳的税款和债务可以不负清偿责任。
二、还款的时间和方式
- 还款时间：若亲戚在您妻子去世后还款，且该还款行为发生在您或您与妻子的共同继承人明确表示接受还款之前，那么该还款行为可能无效，因为此时还款对象尚未确定。
- 还款方式：若亲戚通过银行转账、支付宝、微信等可追溯的方式将借款还给您儿子，并保留了相关证据，如转账记录、聊天记录等，那么该还款行为在法律上可能被视为有效，但前提是您儿子具备接受还款的资格（如作为继承人之一）。若亲戚以现金方式还款，且无法提供有效证据证明还款事实，那么该还款行为可能难以得到法律认可。
三、您儿子的资格与意愿
- 资格：若您儿子是您妻子的合法继承人之一，且未放弃继承权，那么他有权接受亲戚的还款。但若您儿子并非继承人，或者虽为继承人但已放弃继承权，那么他无权接受还款。
- 意愿：即使您儿子具备接受还款的资格，若他明确表示不接受该还款，或者该还款行为未经您或其他共同继承人的同意，那么该还款行为可能无效。
四、建议与措施
- 收集证据：建议您收集与借款相关的所有证据，如借条、转账记录、聊天记录等，以证明借款事实的存在和金额。
- 协商解决：您可以尝试与亲戚协商解决此事，要求其继续履行还款义务或提供有效证据证明已还款给您儿子。
- 法律途径：若协商无果，您可以考虑通过法律途径解决此事，如向法院提起诉讼或申请仲裁等。在诉讼过程中，您需要提供充分证据证明自己的主张，并遵循法院的判决或裁决。
最后，民间借贷和家庭财产纠纷往往涉及复杂的法律关系和情感因素，建议您在处理此类问题时保持冷静和理性，必要时寻求专业律师的帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。