针对您提出的“过了追诉期的贪污罪怎么办”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、基本原则：通常不再追究刑事责任

根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪经过一定期限后，将不再追诉。这一期限，即追诉时效，是根据犯罪的法定最高刑来确定的。对于贪污罪而言，其追诉时效依据犯罪情节和可能判处的刑期而定。若贪污罪已过追诉时效，司法机关通常将不再通过刑事程序追究犯罪嫌疑人的刑事责任。

二、司法机关的具体处理方式

1. 立案阶段：

   • 在立案审查过程中，若公安机关、人民检察院等立案机关发现贪污案件已过追诉时效，应依法作出不立案的决定，以避免启动不必要的刑事立案程序。

2. 侦查、审查起诉阶段：

   • 在侦查阶段，若侦查机关发现案件已过追诉时效，应立即撤销案件，终结侦查活动。
   • 在审查起诉阶段，若人民检察院经审查认定案件已过追诉时效，则应作出不起诉决定，终止刑事诉讼程序。

3. 审判阶段：

   • 若法院在审理过程中查明贪污案件已过追诉时效，应直接终止审理，不再对案件进行实体上的审理和判决。

三、特殊情况下的追诉

尽管存在追诉时效的限制，但在以下特定情形下，即使已过通常的追诉时效期限，仍可对犯罪嫌疑人进行追诉：

• 在人民检察院、公安机关、国家安全机关立案侦查或在人民法院受理案件后，犯罪嫌疑人逃避侦查或审判的；
• 被害人在追诉期限内提出控告，而人民法院、人民检察院、公安机关应当立案而不予立案的。

四、当事人权益保障与替代性法律措施

1. 犯罪嫌疑人、被告人：

   • 一旦司法机关认定案件已过追诉时效，犯罪嫌疑人、被告人将不再因该贪污犯罪行为被追究刑事责任。他们有权在诉讼过程中提出关于追诉时效的抗辩，以维护自己的合法权益。

2. 被害人：

   • 虽然案件因过追诉时效而不再追究犯罪嫌疑人、被告人的刑事责任，但被害人的合法权益仍需得到保障。被害人可以通过民事途径，如向法院提起民事诉讼，要求犯罪人返还贪污所得财物及赔偿因贪污行为所遭受的经济损失。

3. 其他法律措施：

   • 即使不能直接通过刑事程序追究刑事责任，司法机关仍可采取其他法律手段来防止犯罪嫌疑人转移或隐匿通过贪污获得的非法利益，如冻结银行账户、查封财产等。

五、综合建议

处理已过追诉时效的贪污案件时，应综合考虑案件的实际情况和相关法律规定。对于具体案件的处理，我建议您咨询专业律师以获得更准确的法律建议和帮助。律师可以根据您的具体情况，提供针对性的法律策略和解决方案。

综上所述，贪污罪过了追诉时效通常不再追究刑事责任，但在特定情形下仍可追诉。司法机关在处理此类案件时应严格遵守法律规定，确保公正、合理地运用追诉时效制度。同时，当事人也应积极维护自己的合法权益，通过合法途径寻求救济。