在金融犯罪案件中，本金是否应当没收需根据具体犯罪类型、法律规定及案件事实综合判断，并非一概而论。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律框架下的本金没收原则

1. 违法所得没收规则
   根据《刑法》第六十四条，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。这里的“违法所得”通常指通过犯罪行为直接获取的收益，例如诈骗所得、非法经营利润等。本金作为犯罪工具或投入资金，一般不属于违法所得，原则上不直接没收。
   例外情形：若本金与违法所得混同（如诈骗资金与自有资金混合使用），或本金本身系赃款（如用受贿资金投资），则可能被追缴。

2. 特定犯罪的没收规定
   部分金融犯罪明确规定了本金没收条款，例如：

   • 洗钱罪（《刑法》第一百九十一条）：若本金系上游犯罪（如贪污、贩毒）的违法所得，需没收；
     
   • 非法吸收公众存款罪：根据《防范和处置非法集资条例》，非法吸收的资金属于违法所得，需清退集资参与人，但实践中可能优先返还本金（视案件性质而定）；
     
   • 集资诈骗罪：本金作为诈骗对象，通常需全额追缴并返还被害人。

二、司法实践中的本金处理逻辑

1. 区分“犯罪工具”与“违法所得”

   • 犯罪工具：如用于诈骗的手机、电脑，或用于非法集资的账户资金，可能被没收；
     
   • 违法所得：仅指犯罪行为产生的收益（如利息、分红），本金一般返还被害人或上缴国库。
     示例：甲以虚假项目非法集资1000万元，支付利息200万元后潜逃。司法机关会追缴200万元利息（违法所得），并责令退赔1000万元本金（被害人损失）。

2. 被害人保护优先原则
   在涉及众多被害人的案件中（如P2P爆雷），司法机关可能优先通过追缴、退赔程序返还本金，以减少社会矛盾。此时本金虽非严格意义上的“违法所得”，但需通过刑事程序处置。

三、不同犯罪类型的本金处理差异

1. 诈骗类犯罪（如贷款诈骗、票据诈骗）
   本金作为诈骗对象，通常需全额追缴并返还被害人。若本金已被挥霍或转移，可能通过责令退赔、拍卖犯罪人财产等方式执行。

2. 破坏金融管理秩序类犯罪（如非法经营、内幕交易）
   本金一般不被没收，但违法所得（如交易利润）需追缴。若本金系赃款或用于犯罪（如用受贿资金炒股），则可能被没收。

3. 金融诈骗与普通诈骗的区分
   金融诈骗（如集资诈骗）因涉及不特定多数人，司法机关更倾向通过刑事程序返还本金；普通诈骗则可能通过民事诉讼解决本金返还问题。

四、实务建议

1. 对犯罪嫌疑人/被告人：

   • 若本金系合法来源（如自有资金误入犯罪链条），需积极举证证明资金性质，避免被错误追缴；
     
   • 若本金已用于返还被害人或上缴司法机关，可主张从量刑或罚金中酌情考虑。

2. 对被害人：

   • 及时向司法机关申报债权，提供转账记录、合同等证据，主张返还本金；
     
   • 若本金未被追缴，可另行提起民事诉讼要求犯罪人赔偿。

总结：金融犯罪本金是否没收需结合犯罪类型、资金性质及司法实践判断。若您涉及具体案件，建议提供详细信息（如犯罪类型、资金流向等），以便进一步分析。