自然形成的排洪沟没有列入河道管理范围是否合法，不能一概而论，需要结合具体情况和相关法律法规来判断。以下从几个角度进行分析：

1. 河道管理范围的界定：

   • 河道管理范围通常是由水利部门根据相关法律法规和规划来划定的，它包括了河道本身以及为了保障河道行洪安全而划定的周边区域。
   • 如果自然形成的排洪沟在功能上属于河道的一部分，或者对河道行洪有重要影响，那么理论上它应该被纳入河道管理范围。

2. 未列入河道管理范围的可能原因：

   • 历史遗留问题：可能由于历史原因，该排洪沟在之前的河道管理范围划定时未被纳入。
   • 规划调整：随着城市发展和规划调整，原本不属于河道管理范围的区域可能因新的排水需求而被利用，但尚未及时更新河道管理范围。
   • 认定标准差异：不同地区或不同部门对河道管理范围的认定标准可能存在差异，导致某些排洪沟未被纳入。

3. 合法性的判断：

   • 如果排洪沟确实对河道行洪有重要影响，且未被纳入河道管理范围，这可能存在法律风险。因为根据相关法律法规，河道管理范围内的活动需要受到严格监管，以确保河道行洪安全。如果排洪沟未被纳入管理范围，可能导致相关活动缺乏监管，进而影响河道行洪安全。
   • 如果排洪沟对河道行洪影响较小，或者由于特殊原因确实无法纳入河道管理范围，那么未列入可能并不违法。但这种情况下，也需要采取其他措施来确保排洪沟的安全和有效运行，比如加强日常巡查和维护等。

4. 建议措施：

   • 对于相关部门：应定期对河道管理范围进行复查和更新，确保所有对河道行洪有重要影响的区域都被纳入管理范围。同时，加强与其他部门的沟通协调，共同做好河道管理工作。
   • 对于个人或单位：如果发现自然形成的排洪沟未被列入河道管理范围，且担心其可能影响河道行洪安全，可以向当地水利部门反映情况，建议其进行核查和调整。

总结来说，自然形成的排洪沟没有列入河道管理范围是否合法，取决于其是否对河道行洪有重要影响以及相关法律法规和规划的具体要求。如果有疑问或担忧，建议及时向当地水利部门咨询或反映情况。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况给出专业的法律意见。