结论：节假日旷工一天扣三天工资的做法，在大多数情况下是不合法的。这一结论主要基于我国《劳动法》、《劳动合同法》以及《工资支付暂行规定》中的相关规定，同时从法理角度也显得不公平合理。
详细分析：
法律法规的明确性：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》，劳动者享有取得劳动报酬的权利，用人单位应当按时足额支付劳动者劳动报酬，并未赋予用人单位对员工进行罚款的权利。这意味着，用人单位不能随意扣除劳动者的工资作为惩罚。
- 《工资支付暂行规定》第十六条进一步指出，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，且扣除部分不得超过月工资的20%，并需保障剩余工资不低于当地最低工资标准。旷工一天并不直接等同于给用人单位造成了经济损失，因此直接扣三天工资缺乏明确的法律依据。
法理角度的考量：
- 从公平合理原则出发，旷工一天仅代表劳动者当天未提供劳动，用人单位有权不支付当天的工资作为对缺勤行为的回应。但额外扣除两天工资则构成了超出合理范围的惩罚，损害了劳动者的合法权益，也破坏了劳动关系的和谐稳定。
企业规章制度的有效性：
- 尽管某些用人单位的规章制度中可能规定了“旷工一天扣三天工资”的条款，但这并不意味着该条款必然合法有效。规章制度的制定需通过民主程序，内容不得违反法律法规，且必须向劳动者公示或告知。即使满足这些条件，如果条款内容过于苛刻或不合理，司法实践中也可能因过度惩罚而被视为无效。
劳动者的应对措施：
- 面对不合理的克扣工资行为，劳动者首先应与用人单位协商解决，表达自己的诉求和理由。
- 如果协商不成，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在必要时，还可以依法提起诉讼。
综合建议：
- 对于用人单位而言，在制定规章制度时，应确保其内容符合法律法规的要求，避免过度惩罚员工。合理的规章制度应既能维护企业的正常运营秩序，又能保障劳动者的合法权益。
- 对于劳动者而言，在遇到类似纠纷时，应了解自己的权益并采取适当的法律措施来维权。同时，也应增强法律意识，遵守相关法律法规和企业的规章制度，共同营造一个公平、合理的劳动环境。
可能的法律后果：
- 如果用人单位坚持执行不合理的扣罚制度，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括责令限期支付劳动者的工资报酬、加付赔偿金等。
- 在劳动仲裁或诉讼中，用人单位也可能因规章制度不合法或不合理而承担败诉的风险，需要支付劳动者被克扣的工资及可能的赔偿金。
总之，节假日旷工一天扣三天工资的做法在法律上通常是不被认可的。用人单位和劳动者都应遵守相关法律法规，共同维护劳动关系的和谐稳定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。