员工受贿后将钱退回公司，公司应首先明确该行为的法律性质，并依据公司规章制度及法律规定进行妥善处理，具体处理方式需分情况讨论：
若员工受贿行为尚未构成犯罪，但违反公司规章制度：
- 内部处理：公司应依据内部规章制度，如员工手册、反腐败政策等，对员工进行纪律处分。处分措施可能包括警告、记过、降职、解雇等，具体取决于受贿的严重程度、公司政策以及员工过往表现等因素。
- 教育整改：除了纪律处分外，公司还应加强对员工的教育和培训，提高员工的法律意识和职业道德水平，防止类似事件再次发生。
- 完善制度：公司应借此机会审视并完善内部反腐败机制，包括加强监督、审计和举报渠道等，以构建更加透明、公正的工作环境。
若员工受贿行为已构成犯罪：
- 立即报警：公司应立即向公安机关报案，提供相关证据，协助司法机关进行调查和起诉。受贿行为可能涉及非国家工作人员受贿罪等刑事犯罪，依法应受到刑事处罚。
- 配合调查：在司法机关调查过程中，公司应积极配合，提供必要的协助和证据，确保案件得到公正处理。
- 内部追责：同时，公司也应依据内部规章制度对涉事员工进行纪律处分，并考虑是否对其提起民事诉讼，要求赔偿公司因受贿行为所遭受的损失。
- 加强合规管理：公司应进一步加强合规管理，确保所有业务活动均符合法律法规和道德规范，避免类似犯罪行为的发生。
额外建议：
- 保护举报人：如果受贿行为是通过内部举报发现的，公司应确保举报人的信息安全，并保护其免受报复。
- 公开透明：在处理此类事件时，公司应保持公开透明，及时向员工和公众通报处理结果，以维护公司形象和信誉。
- 法律咨询：在处理过程中，公司可寻求专业法律意见，确保处理方式合法合规，避免引发不必要的法律纠纷。
总结来说，员工受贿后将钱退回公司，并不意味着公司可以忽视或掩盖该行为。公司应根据受贿行为的严重程度和法律性质，采取相应的处理措施，并加强内部管理和合规建设，以维护公司的利益和声誉。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。