核心结论：申请支付令异议书只提交了一份，一般情况下需尽快补交至法定份数，避免因程序瑕疵影响异议效力。以下从法律要求、补救措施、风险提示三个角度展开说明：

1. 法律对异议书份数的要求

根据《民事诉讼法》第214条及司法实践，支付令异议书需向受理支付令的基层人民法院提交，且通常要求一式两份（一份交法院，一份由法院转交申请人）。若仅提交一份，可能因份数不足导致：

• 法院无法及时将异议书副本送达申请人，程序存在瑕疵；
• 申请人可能主张未收到异议书，进而质疑异议的合法性。

2. 补救措施：立即补交副本

建议尽快采取以下行动：

• 联系法院：立即与受理支付令的法院立案庭或承办法官沟通，说明仅提交一份的情况，询问是否需要补交副本；
• 补交材料：根据法院要求，补充提交异议书副本（通常需加盖法院收件章或附送达回证），确保申请人能收到副本；
• 保留证据：保存补交时的邮寄凭证、法院收件记录等，证明已履行补交义务。

3. 风险提示：程序瑕疵的后果

若未及时补交副本，可能面临以下风险：

• 异议被驳回：法院可能以“程序不合法”为由裁定终结督促程序，支付令生效；
• 丧失异议权：若支付令生效后未在15日内提出异议，申请人可申请强制执行，债务人需通过执行异议或另诉解决；
• 增加诉讼成本：若支付令生效后需通过其他程序救济（如执行异议之诉），可能耗费更多时间和费用。

4. 特殊情况处理

若法院已将异议书副本送达申请人，或申请人明确表示收到异议书，则仅提交一份的瑕疵可能被弥补。但仍建议补交副本，以避免后续争议。

总结：支付令异议书仅提交一份属于程序瑕疵，但通过及时补交副本、与法院沟通，通常可纠正。若已错过补交时机，需评估支付令是否生效，并考虑通过执行异议或另诉救济。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合案情提供针对性建议。