盗窃摩托车价值5000元且嫌疑人逃往外地的，属于刑事案件，公安机关会依法立案侦查并追捕嫌疑人，受害人应及时报案并配合调查，同时可依法主张民事赔偿。具体分析如下：

1. 刑事立案与追捕
   根据《刑法》第二百六十四条，盗窃公私财物价值达到“数额较大”（通常为1000元至3000元以上，具体标准由各省确定，5000元一般已达立案标准）的，构成盗窃罪，处三年以下有期徒刑、拘役或管制。

   • 嫌疑人逃往外地不影响案件管辖，公安机关会通过全国联网的侦查系统（如技术侦查、协查通报、网上追逃等）实施抓捕。
     
   • 受害人应立即向案发地公安机关报案，提供摩托车信息（如车牌、车架号）、嫌疑人特征及逃跑方向等线索，协助警方快速立案。

2. 刑事诉讼程序

   • 侦查阶段：公安机关会调查取证（如监控录像、证人证言），锁定嫌疑人后实施抓捕。若嫌疑人被抓获，会依法采取刑事强制措施（如刑事拘留、逮捕）。
     
   • 审查起诉阶段：案件移送检察院后，检察院会审查证据是否充分，决定是否提起公诉。
     
   • 审判阶段：法院会根据犯罪事实、情节（如是否累犯、是否退赃）判处刑罚，并责令退赔受害人损失。

3. 民事赔偿主张

   • 根据《刑事诉讼法》第一百零一条，受害人因犯罪行为遭受物质损失的，有权在刑事诉讼中提起附带民事诉讼，要求嫌疑人赔偿摩托车价值及因盗窃产生的其他合理费用（如交通费、误工费）。
     
   • 若嫌疑人无财产可供执行，受害人可在发现其财产后申请强制执行。

4. 实务建议

   • 保留证据：保存购车发票、行驶证等证明摩托车价值的材料，以及报案回执、案件进展通知等文件。
     
   • 关注案件进展：定期与办案民警沟通，了解抓捕、侦查情况，必要时可申请作为证人参与诉讼。
     
   • 防范二次风险：若摩托车被转卖，可向公安机关说明情况，协助追缴赃物；若嫌疑人通过非法手段转移财产，可申请法院撤销相关行为。

提示：刑事案件的侦查、起诉、审判周期较长，受害人需保持耐心。若对案件处理有疑问（如证据收集、赔偿计算），可直接向我咨询具体法律问题。