针对您提出的“养殖场占用了基本农田怎么办”这一问题，这是一个涉及法律法规和土地管理的重要事项，需要谨慎处理。以下是我为您提供的详细解答：
一、明确法律立场
首先，必须明确指出，占用基本农田建设养殖场是违法的行为。基本农田是保障国家粮食安全和重要农产品供给的关键资源，受到法律的严格保护。因此，任何未经合法审批占用基本农田进行非农业建设的行为，都将受到法律的制裁。
二、立即停止违法行为
如果您已经占用了基本农田建设养殖场，或者发现他人有此类行为，应立即停止。土地管理部门在发现此类违法行为后，会迅速介入，责令停止违法行为，以防止对基本农田的进一步破坏。
三、处理措施
限期拆除与恢复：
- 对于未经合法审批手续在基本农田上建设的养殖场，相关部门将要求当事人在规定时间内自行拆除新建的建筑物和其他设施，并恢复土地原状。
- 若未在规定期限内完成拆除，相关部门有权依法组织强制拆除，且拆除费用由违法当事人承担。
整改与补办手续：
- 如果养殖场建设经过部分合法程序，但存在不符合规定之处，或者在满足一定条件下可以补办手续使其合法化，当事人应积极配合相关部门进行整改。
- 整改内容可能包括完善用地审批手续、调整养殖场布局等，以确保不对基本农田造成实质性破坏。
行政处罚：
- 违法当事人还将面临行政处罚，如罚款。罚款额度将根据具体的违法情节严重程度、占用农田的面积大小、对农田的损害程度以及当事人的整改态度等因素综合确定。
刑事责任追究：
- 若占用基本农田的数量较大，造成基本农田大量毁坏，达到《刑法》规定的犯罪标准，相关责任人将面临刑事责任的追究。根据《刑法》的相关规定，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大且造成农用地大量毁坏的，可处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
四、合法用地建议
了解政策法规：
- 在考虑占用土地进行养殖业之前，务必详细了解当地关于基本农田保护、土地使用、养殖业发展以及环保等方面的最新政策和法规。
咨询相关部门：
- 建议咨询当地的农业部门、自然资源主管部门、环保部门等，以明确具体的审批流程、要求及限制条件。
依法申请用地：
- 如需占用耕地进行建设，应依法申请农用地转用审批手续，确保用地合法。在符合特定条件下，可以进行设施农业建设用于养殖，但必须确保合规性并接受相关部门监管。
五、总结与提醒
养殖场占用基本农田是一个复杂且敏感的问题，涉及法律法规和土地管理等多个方面。为了确保养殖业的可持续发展和土地的合理利用，我强烈建议您在规划养殖场建设时务必遵守国家法律法规，珍惜和保护基本农田资源。如果已经占用了基本农田，应立即停止违法行为，并积极配合相关部门进行整改和处理。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。